10        20          30        40        50         
AUGAAGAUUGAGGUUGGAUUC--|  A     UC               G     GUGUU 
                       CUG UUUUA  UUUGGUUAUCUAGCU UAUGA     U
                       GGC AAAAU  AAGCCAAUAGAUCGA AUACU     C
ACAGUUUCCUACUUAUUCCCUUU^  A     GA               A     UCGGA 
.       110       100        90        80        70        60