10          20        30        40        50         
AAGCAGCCGAAUGACAA--|   GCUA   C         CU      AG   UGUAGCA 
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                   CCGG    GUG AAAUGUAGA  GGUACA  AGU       A
AAGUUGACGUCGACAUAGA^   AGUA   C         AG      GA   AACAUUA 
       110       100        90        80        70        60