10        20        30            40        50        
AUCAGCACCGCUCUGGGGUA    G         C----|     U   AA    AUUGUC 
                    UGGG ACGGAUGGU     GACCAG UGG  AGUA      \
                    ACCC UGCCUGCCG     CUGGUC ACU  UCAU      C
ACCCGGGCGUCCGCCGUC--    A         AUCAC^     C   --    GUAACC 
   110       100          90        80        70          60