MirGeneDB ID | Hsa-Mir-1323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-1323 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAAAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-1323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mml-Mir-1323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr19: 53671978-53672033 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1323) |
Mir-430-P8b
chr19: 53666693-53666750 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P8a chr19: 53669177-53669234 [+] UCSC Ensembl Mir-1323 chr19: 53671978-53672033 [+] UCSC Ensembl Mir-498 chr19: 53674230-53674289 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P25 chr19: 53675725-53675785 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P9b chr19: 53679016-53679074 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P20 chr19: 53679953-53680011 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P26 chr19: 53682173-53682233 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P9a chr19: 53685022-53685080 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P18 chr19: 53686484-53686543 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P49 chr19: 53688495-53688553 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P21 chr19: 53690895-53690953 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P47 chr19: 53694406-53694464 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P17 chr19: 53695225-53695284 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P44 chr19: 53697547-53697605 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P42 chr19: 53698400-53698458 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P14 chr19: 53700030-53700088 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P22 chr19: 53701228-53701288 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P10 chr19: 53702750-53702808 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P45 chr19: 53706266-53706324 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P23 chr19: 53707468-53707527 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P11 chr19: 53708759-53708817 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P43 chr19: 53711017-53711075 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35a chr19: 53712282-53712342 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P19 chr19: 53713361-53713422 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P29b chr19: 53716608-53716668 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P24 chr19: 53720111-53720170 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P35b chr19: 53721081-53721139 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGUCAGACAUGACAUUCAGACUGAGGUCCUCAAAACUGAGGGGCAUUUUCUGUGGUUUGAAAGGAAAGUGCACCCAGUUUUGGGGAUGUCAAUUGUGAAUCCUCAUCAUAACCCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AAGUCAGACAUGACAUUCAGAC--| G A G GUGGU UGA GUCCUCAAAACUG GG GCAUUUUCU \ ACU UAGGGGUUUUGAC CC CGUGAAAGG U ACCCAAUACUACUCCUAAGUGUUA^ G - A AAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Mir-1323_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0005795 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAAAACUGAGGGGCAUUUUCU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005795 TargetScanVert: hsa-miR-1323 TargetMiner: hsa-miR-1323 miRDB: MIMAT0005795 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Mir-1323_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AAAGUGCACCCAGUUUUGGGG -56
Get sequence
|