MirGeneDB ID | Hsa-Mir-506-P12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUGGCU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-892b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-506-P1 Hsa-Mir-506-P2 Hsa-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P4a1 Hsa-Mir-506-P4a2 Hsa-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P5 Hsa-Mir-506-P6a1 Hsa-Mir-506-P6a2 Hsa-Mir-506-P6b Hsa-Mir-506-P6c Hsa-Mir-506-P7a Hsa-Mir-506-P7b Hsa-Mir-506-P7c Hsa-Mir-506-P8 Hsa-Mir-506-P9 Hsa-Mir-506-P10 Hsa-Mir-506-P11 Hsa-Mir-506-P13 Hsa-Mir-506-P29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mml-Mir-506-P12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 145997208-145997264 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P12) |
Mir-506-P13
chrX: 145992760-145992816 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P10 chrX: 145994285-145994341 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P9 chrX: 145994794-145994850 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P11 chrX: 145996678-145996734 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P12 chrX: 145997208-145997264 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCGCAAUCAGCCAUGCUGUGUGCAAUGCCCUACUCAGAAAGGUGCCAUUUAUGUAGAUUUUAUGUCACUGGCUCCUUUCUGGGUAGAGCAAGGCUCACCAUGUAUAUAUUUGUGGUGGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCGCAAUCAGCCAUGCU--| U AA C U UUUAUGUAGA GUG GC UGC CUACUCAGAAAGG GCCA \ CAC CG ACG GAUGGGUCUUUCC CGGU U GUGGUGUUUAUAUAUGUAC^ U GA A U CACUGUAUUU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-506-P12_5p* |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCAGAAAGGUGCCAUUUAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Hsa-Mir-506-P12_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004918 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CACUGGCUCCUUUCUGGGUAGA -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004918 TargetScanVert: hsa-miR-892b TargetMiner: hsa-miR-892b miRDB: MIMAT0004918 |