| MirGeneDB ID | Mml-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1298 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1298 Cfa-Mir-1298 Cpo-Mir-1298 Ete-Mir-1298 Hsa-Mir-1298 Mmu-Mir-1298 Ocu-Mir-1298 Rno-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 108589583-108589658 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1298) |
Mir-1298
chrX: 108589583-108589658 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1911 chrX: 108624040-108624098 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAGCUGUUGGAGAGACGAGGAGUUAAGAGUUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUAUCCAAGUAUCCUCUGUUAUUUGGCAAUAAAUACAUCUGGGCAACUGACUGAACUUUUCGCUUUUCAUGACUCAGCUGGAACCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAGCUGUUGGAGAGAC--| U U C UCCAAGUAUCCUCU GAGGAGU AAGAGUUCA UCGG UGUCCAGAUGUA G CUUUUCG UUUUCAAGU AGUC ACGGGUCUACAU U UCCCAAGGUCGACUCAGUA^ C C A AAAUAACGGUUUAU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mml-Mir-1298_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0024316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1298-5p |
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| Star sequence | Mml-Mir-1298_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0027109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
54- CAUCUGGGCAACUGACUGAACU -76
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-1298-3p |
