MirGeneDB ID | Mml-Mir-506-P6b2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCACAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-513b-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-506-P1 Mml-Mir-506-P2 Mml-Mir-506-P3 Mml-Mir-506-P4d Mml-Mir-506-P4e Mml-Mir-506-P4f Mml-Mir-506-P5 Mml-Mir-506-P6a Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6c1 Mml-Mir-506-P6c2 Mml-Mir-506-P7a Mml-Mir-506-P8 Mml-Mir-506-P9 Mml-Mir-506-P10 Mml-Mir-506-P11 Mml-Mir-506-P12 Mml-Mir-506-P13 Mml-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P6 Cpo-Mir-506-o6 Cpo-Mir-506-P6 Hsa-Mir-506-P6b Ocu-Mir-506-P6 Rno-Mir-506-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. mulatta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 140902118-140902175 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P6b2) |
Mir-506-P6b2
chrX: 140902118-140902175 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6b1 chrX: 140909251-140909308 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6c1 chrX: 140924370-140924427 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a chrX: 140933343-140933400 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 140946831-140946887 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 140947157-140947214 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAUUCAGCCAUUCGGUUUACAGUGCCUUUCACAAGGAGGUGUCAUUUAUGUGAACUAAACUAUAAAUGUCACCUUUUUGGGAAGAGUAAUGUACAACAUGCACUGCAAAUGUGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAUUCAGCCAUUCG- - G -| A U GUGAA GUU UACA UGC CUUUC CAAGGAGGUG CAUUUAU C CAA AUGU AUG GAAGG GUUUUUCCAC GUAAAUA U UGGUGUAAACGUCACGUA C A A^ - U UCAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-506-P6b2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCACAAGGAGGUGUCAUUUAU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-513b |
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Star sequence | Mml-Mir-506-P6b2_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AAAUGUCACCUUUUUGGGAAGA -58
Get sequence
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