MirGeneDB ID | Mml-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-95-P1 Mml-Mir-95-P2 Mml-Mir-95-P3-v1 Mml-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-95-P3-v1 Bta-Mir-95-P3-v2 Cfa-Mir-95-P3-v1 Cfa-Mir-95-P3-v2 Cpo-Mir-95-P3 Dno-Mir-95-P3-v1 Dno-Mir-95-P3-v2 Hsa-Mir-95-P3-v1 Hsa-Mir-95-P3-v2 Ocu-Mir-95-P3-v1 Ocu-Mir-95-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 68840446-68840505 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-95-P3-v2) |
Mir-95-P3-v1
chrX: 68840445-68840507 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-95-P3-v2 chrX: 68840446-68840505 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 chrX: 68840617-68840668 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAGAGCCCAGCCUGGCACAUUAGUAGGCCUCAGUAAAUGUUUAUUAGAUGAAUAAAUGAAUGACUCAUCAGCAAACAUUUAUUGUGUGCCUGCUAAAGUGAGCUCCACAGGCUCUGGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCAGAGCCCAGCCUGGC--- A CU-| A A AUAAAU AC UUAGUAGGC CAGUAAAUGUUU UU GAUGA \ UG AAUCGUCCG GUUAUUUACAAA GA CUACU G CAGGUCUCGGACACCUCGAG A UGU^ C - CAGUAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-95-P3-v2_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAGUAAAUGUUUAUUAGAUGA -22
Get sequence
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Star sequence | Mml-Mir-95-P3-v2_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0006409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUCAGCAAACAUUUAUUGUGUGC -60
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-545 |