MirGeneDB ID | Mmu-Mir-506-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmu-Mir-506-P1 Mmu-Mir-506-P2 Mmu-Mir-506-P14 Mmu-Mir-506-P15a Mmu-Mir-506-P15b1 Mmu-Mir-506-P15b2 Mmu-Mir-506-P15c1 Mmu-Mir-506-P15c2 Mmu-Mir-506-P15d Mmu-Mir-506-P16 Mmu-Mir-506-P17 Mmu-Mir-506-P18 Mmu-Mir-506-P19 Mmu-Mir-506-P20 Mmu-Mir-506-P21 Mmu-Mir-506-P22 Mmu-Mir-506-P23 Mmu-Mir-506-P24 Mmu-Mir-506-P25 Mmu-Mir-506-P26 Mmu-Mir-506-P27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-506-P7 Cpo-Mir-506-o7a Cpo-Mir-506-o7b Cpo-Mir-506-o7c Dno-Mir-506-P7f Dno-Mir-506-P7g Dno-Mir-506-P7h Dno-Mir-506-P7i Hsa-Mir-506-P7a Hsa-Mir-506-P7b Hsa-Mir-506-P7c Mml-Mir-506-P7a Ocu-Mir-506-P7d Ocu-Mir-506-P7e Rno-Mir-506-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chrX: 68010114-68010170 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P7) |
Mir-506-P1
chrX: 67988099-67988156 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P2 chrX: 67988383-67988440 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P7 chrX: 68010114-68010170 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGUUGAUUGUGAUAACUGUGUGUGGUUCUUUACUCCAGAAUGUGGCAAUCAUGCAUAAUUAAAUGUGAUUGACAUUUCUGUAAUGGAGUAACACAUGUGAUAUAUGGCAUGUGCAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGUUGAUUGUGAUAACU----| GG UUACUC U G GCAUA GUGUGU UUCU CAGAA GUG CAAUCAU A UACACA GAGG GUCUU UAC GUUAGUG U UAACGUGUACGGUAUAUAGUG^ AU UAAU-- - A UAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-506-P7_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0004890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACUCCAGAAUGUGGCAAUCAUG -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004890 TargetScanVert: mmu-miR-509-5p miRDB: MIMAT0004890 |
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Co-mature sequence | Mmu-Mir-506-P7_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0004891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UGAUUGACAUUUCUGUAAUGGA -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004891 TargetScanVert: mmu-miR-509-3p miRDB: MIMAT0004891 |