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Aca-Mir-126-P2-v3

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 12637.73/746.17 = 16.94
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4688.03/365.42 = 12.83

mature (isoform content): 27.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.87% (heterogeneous)

skeletal-muscle_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 1557.0/61.0 = 25.52
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 702.0/58.0 = 12.1

mature (isoform content): 31.08% (heterogeneous)
star (isoform content): 48.74% (heterogeneous)

tail-base-25day-regenerating_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 15791.0/1242.0 = 12.71
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3807.0/370.0 = 10.29

mature (isoform content): 19.43% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.95% (heterogeneous)

tail-tip-25day-regenerating_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 11810.0/1363.0 = 8.66
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2697.0/316.0 = 8.53

mature (isoform content): 18.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.82% (heterogeneous)

total_animal_aca

ratio mature/star: 9793.0/672.0 = 14.57
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1337.0/125.0 = 10.7

mature (isoform content): 12.01% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.68% (heterogeneous)

whole-brain_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 13881.0/360.0 = 38.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8058.0/414.0 = 19.46

mature (isoform content): 36.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 53.49% (heterogeneous)

skeletal-muscle_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 1557.0/61.0 = 25.52

tail-base-25day-regenerating_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 15791.0/1242.0 = 12.71

tail-tip-25day-regenerating_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 11810.0/1363.0 = 8.66

total_animal_aca

ratio mature/star: 9793.0/672.0 = 14.57

whole-brain_aca_PRJNA278692

ratio mature/star: 13881.0/360.0 = 38.56

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	A	U	U	A	C	U	U	U	U	G	G	U	A	C	G	C	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	89	16.27	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	A	U	U	A	C	U	U	U	U	G	G	U	A	C	G	C	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	202	34.85	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	A	U	U	A	C	U	U	U	U	G	G	U	A	C	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2789	562.97	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	U	A	U	U	A	C	U	U	U	U	G	G	U	A	C	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	451	95.23	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	21	9.33	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	G	G	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.35	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	G	G	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.11	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	G	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.16	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	C	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5	3.54	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	0.57	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	3.23	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	U	U	G	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.11	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	G	U	G	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.19	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	G	U	G	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	0.76	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	G	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6	1.07	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.22	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	9	4.18	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.19	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6	0.91	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	C	G	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.3	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	C	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	4.5	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	353	53.04	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	88	17.19	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	C	G	U	A	C	C	G	U	G	A	G	U	A	A	U	A	A	U	G	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.11	Aca-Mir-126-P2-v2, Aca-Mir-126-P2-v1
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References
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