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Aca-Mir-216-P2a

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 30.78/17.59 = 1.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.1/1.57 = 0.7

mature (isoform content): 3.45% (homogeneous)
star (isoform content): 8.2% (homogeneous)

total_animal_aca

ratio mature/star: 196.0/112.0 = 1.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7.0/10.0 = 0.7

mature (isoform content): 3.45% (homogeneous)
star (isoform content): 8.2% (homogeneous)

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	A	G	U	U	A	C	C	A	G	C	A	G	A	G	G	U	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	15	2.36
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References
Tissue	Paper	Accesion
whole-brain_aca_PRJNA278692	PRJNA278692	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27150582
skeletal-muscle_aca_PRJNA278692	PRJNA278692	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27150582
tail-tip-25day-regenerating_aca_PRJNA278692	PRJNA278692	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27150582
tail-base-25day-regenerating_aca_PRJNA278692	PRJNA278692	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27150582
total_animal_aca	NA	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19196333/