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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606	SRR4252606	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
embryo-day-0-1_bge_SRR4252607	SRR4252607	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Bantam

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 10403.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1520.0/0.0 = None

mature (isoform content): 12.75% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 35161.0/11.0 = 3196.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7265.0/4.0 = 1816.25

mature (isoform content): 17.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 26.67% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 490.0/1.0 = 490.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 163.0/1.0 = 163.0

mature (isoform content): 24.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 9157.0/2.0 = 4578.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1090.0/0.0 = None

mature (isoform content): 10.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 32863.0/10.0 = 3286.3
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6574.0/1.0 = 6574.0

mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.09% (homogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 21976.0/6.0 = 3662.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4138.0/2.0 = 2069.0

mature (isoform content): 15.85% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 15473.0/5.0 = 3094.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2320.0/1.0 = 2320.0

mature (isoform content): 13.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 52092.0/27.0 = 1929.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6799.0/7.0 = 971.29

mature (isoform content): 11.55% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.59% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 61297.0/18.0 = 3405.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8633.0/0.0 = None

mature (isoform content): 12.35% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 129635.0/38.0 = 3411.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7006.0/2.0 = 3503.0

mature (isoform content): 5.13% (homogeneous)
star (isoform content): 5.0% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 117.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 43.0/0.0 = None

mature (isoform content): 26.88% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 50499.0/5.0 = 10099.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10765.0/3.0 = 3588.33

mature (isoform content): 17.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.5% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 2081.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 447.0/0.0 = None

mature (isoform content): 17.68% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 30083.0/22.0 = 1367.41
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3096.0/9.0 = 344.0

mature (isoform content): 9.33% (homogeneous)
star (isoform content): 29.03% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 102.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 52.0/0.0 = None

mature (isoform content): 33.77% (heterogeneous)
star (isoform content): None

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 8833.0/1.0 = 8833.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1677.0/0.0 = None

mature (isoform content): 15.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 7395.0/3.0 = 2465.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 454.0/0.0 = None

mature (isoform content): 5.78% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 7504.0/5.0 = 1500.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1199.0/0.0 = None

mature (isoform content): 13.78% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 128.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 50.0/0.0 = None

mature (isoform content): 28.09% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 5591.0/2.0 = 2795.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1333.0/0.0 = None

mature (isoform content): 19.25% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 19649.0/4.0 = 4912.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1570.0/1.0 = 1570.0

mature (isoform content): 7.4% (homogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 51.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 27.0/0.0 = None

mature (isoform content): 34.62% (heterogeneous)
star (isoform content): None

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 8969.0/3.0 = 2989.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1206.0/1.0 = 1206.0

mature (isoform content): 11.85% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 29.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10.0/0.0 = None

mature (isoform content): 25.64% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 31881.0/12.0 = 2656.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1922.0/0.0 = None

mature (isoform content): 5.69% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 24831.0/5.0 = 4966.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1655.0/0.0 = None

mature (isoform content): 6.25% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 1250.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 231.0/0.0 = None

mature (isoform content): 15.6% (heterogeneous)
star (isoform content): None

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 10403.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 35161.0/11.0 = 3196.45

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ratio mature/star: 490.0/1.0 = 490.0

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ratio mature/star: 9157.0/2.0 = 4578.5

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 32863.0/10.0 = 3286.3

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 21976.0/6.0 = 3662.67

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 15473.0/5.0 = 3094.6

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ratio mature/star: 52092.0/27.0 = 1929.33

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ratio mature/star: 61297.0/18.0 = 3405.39

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ratio mature/star: 129635.0/38.0 = 3411.45

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ratio mature/star: 117.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 50499.0/5.0 = 10099.8

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ratio mature/star: 30083.0/22.0 = 1367.41

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ratio mature/star: 102.0/0.0 = None

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 8833.0/1.0 = 8833.0

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G	U	A	C	A	G	C	A	U	C	U	G	C	C	A	A	G	C	C	A	U	G	A	G	A	C	G	A	A	G	C	C	G	G	U	U	U	U	C	A	C	A	G	U	G	A	U	U	U	G	C	C	A	G	A	U	A	U	G	U	U	A	A	A	U	U	C	U	G	A	G	A	U	C	A	U	U	G	U	G	A	A	A	G	C	U	G	A	U	U	U	U	G	U	U	G	A	G	U	A	G	C	U	C	U	U	C	A	G	G	A	A	A	G	C	A	G	C	A	C

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