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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-10-P1-v1

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dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 4233.0/167.0 = 25.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 723.0/67.0 = 10.79

mature (isoform content): 14.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.63% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 70275.0/4053.0 = 17.34
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 21160.0/888.0 = 23.83

mature (isoform content): 23.14% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.97% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 851.0/46.0 = 18.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 327.0/8.0 = 40.88

mature (isoform content): 27.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.81% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 5056.0/260.0 = 19.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 796.0/69.0 = 11.54

mature (isoform content): 13.6% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.97% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 35246.0/2004.0 = 17.59
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9727.0/447.0 = 21.76

mature (isoform content): 21.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.24% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 27190.0/1464.0 = 18.57
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7833.0/317.0 = 24.71

mature (isoform content): 22.37% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.8% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 49623.0/1951.0 = 25.43
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10297.0/294.0 = 35.02

mature (isoform content): 17.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.1% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 172742.0/8999.0 = 19.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 30442.0/1520.0 = 20.03

mature (isoform content): 14.98% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.45% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 50180.0/3225.0 = 15.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8076.0/463.0 = 17.44

mature (isoform content): 13.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.55% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 153371.0/6007.0 = 25.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14975.0/459.0 = 32.63

mature (isoform content): 8.9% (homogeneous)
star (isoform content): 7.1% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 200.0/5.0 = 40.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 31.0/1.0 = 31.0

mature (isoform content): 13.42% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 62029.0/2102.0 = 29.51
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 19791.0/514.0 = 38.5

mature (isoform content): 24.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.65% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 3672.0/52.0 = 70.62
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1283.0/14.0 = 91.64

mature (isoform content): 25.89% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.21% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 45221.0/2226.0 = 20.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5865.0/319.0 = 18.39

mature (isoform content): 11.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.53% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 79.0/1.0 = 79.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8.0/2.0 = 4.0

mature (isoform content): 9.2% (homogeneous)
star (isoform content): 66.67% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 13584.0/765.0 = 17.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3729.0/124.0 = 30.07

mature (isoform content): 21.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.95% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 39108.0/2473.0 = 15.81
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3761.0/164.0 = 22.93

mature (isoform content): 8.77% (homogeneous)
star (isoform content): 6.22% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 2232.0/64.0 = 34.88
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 535.0/12.0 = 44.58

mature (isoform content): 19.34% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.79% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 218.0/3.0 = 72.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 60.0/3.0 = 20.0

mature (isoform content): 21.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 30278.0/1339.0 = 22.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10725.0/240.0 = 44.69

mature (isoform content): 26.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.2% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 8584.0/596.0 = 14.4
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 953.0/80.0 = 11.91

mature (isoform content): 9.99% (homogeneous)
star (isoform content): 11.83% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 44.0/1.0 = 44.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11.0/0.0 = None

mature (isoform content): 20.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 5838.0/304.0 = 19.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1040.0/56.0 = 18.57

mature (isoform content): 15.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.56% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 93.0/29.0 = 3.21
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 38.0/4.0 = 9.5

mature (isoform content): 29.01% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.12% (heterogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 42107.0/2139.0 = 19.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3474.0/191.0 = 18.19

mature (isoform content): 7.62% (homogeneous)
star (isoform content): 8.2% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 23099.0/1989.0 = 11.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2062.0/156.0 = 13.22

mature (isoform content): 8.2% (homogeneous)
star (isoform content): 7.27% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 1984.0/155.0 = 12.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 351.0/24.0 = 14.63

mature (isoform content): 15.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.41% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 4233.0/167.0 = 25.35

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 70275.0/4053.0 = 17.34

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 851.0/46.0 = 18.5

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 5056.0/260.0 = 19.45

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 35246.0/2004.0 = 17.59

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 27190.0/1464.0 = 18.57

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 49623.0/1951.0 = 25.43

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 172742.0/8999.0 = 19.2

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 50180.0/3225.0 = 15.56

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 153371.0/6007.0 = 25.53

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 200.0/5.0 = 40.0

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 62029.0/2102.0 = 29.51

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 3672.0/52.0 = 70.62

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 45221.0/2226.0 = 20.31

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ratio mature/star: 79.0/1.0 = 79.0

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ratio mature/star: 13584.0/765.0 = 17.76

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 39108.0/2473.0 = 15.81

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ratio mature/star: 2232.0/64.0 = 34.88

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ratio mature/star: 218.0/3.0 = 72.67

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ratio mature/star: 30278.0/1339.0 = 22.61

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ratio mature/star: 8584.0/596.0 = 14.4

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ratio mature/star: 5838.0/304.0 = 19.2

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ratio mature/star: 93.0/29.0 = 3.21

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 42107.0/2139.0 = 19.69

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 23099.0/1989.0 = 11.61

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ratio mature/star: 1984.0/155.0 = 12.8

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U	C	A	C	C	A	G	C	A	C	A	G	A	A	G	U	A	A	U	G	C	U	C	U	A	C	A	U	C	U	A	C	C	C	U	G	U	A	G	A	U	C	C	G	A	A	U	U	U	G	U	U	U	G	A	C	A	U	U	G	G	G	C	G	A	C	A	A	A	U	U	C	G	G	U	U	C	U	A	G	A	G	A	G	G	U	U	U	G	U	G	U	G	G	U	G	C	A	U	A	C	A	A	U	G	C	A	A	C	G	U	G	C	A	A	C	C	A

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