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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606	SRR4252606	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
embryo-day-0-1_bge_SRR4252607	SRR4252607	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Mir-2-P7

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 160.0/5.0 = 32.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 55.0/1.0 = 55.0

mature (isoform content): 25.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1817.0/123.0 = 14.77
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 604.0/29.0 = 20.83

mature (isoform content): 24.95% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.08% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 290.0/401.0 = 0.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 103.0/81.0 = 1.27

mature (isoform content): 26.21% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.8% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 139.0/13.0 = 10.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 52.0/2.0 = 26.0

mature (isoform content): 27.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.33% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 800.0/82.0 = 9.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 227.0/24.0 = 9.46

mature (isoform content): 22.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.64% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 468.0/35.0 = 13.37
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 145.0/12.0 = 12.08

mature (isoform content): 23.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.53% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 307.0/76.0 = 4.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 77.0/24.0 = 3.21

mature (isoform content): 20.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 24.0% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 9560.0/599.0 = 15.96
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1939.0/104.0 = 18.64

mature (isoform content): 16.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.79% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 1160.0/181.0 = 6.41
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 258.0/30.0 = 8.6

mature (isoform content): 18.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.22% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 1551.0/256.0 = 6.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 247.0/11.0 = 22.45

mature (isoform content): 13.74% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.12% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 27.0/13.0 = 2.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 42.0/8.0 = 5.25

mature (isoform content): 60.87% (heterogeneous)
star (isoform content): 38.1% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 602.0/46.0 = 13.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 181.0/12.0 = 15.08

mature (isoform content): 23.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.69% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 139.0/39.0 = 3.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 44.0/8.0 = 5.5

mature (isoform content): 24.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.02% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 397.0/74.0 = 5.36
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 65.0/9.0 = 7.22

mature (isoform content): 14.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.84% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 30.0/35.0 = 0.86
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 43.0/9.0 = 4.78

mature (isoform content): 58.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.45% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 91.0/26.0 = 3.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 44.0/5.0 = 8.8

mature (isoform content): 32.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.13% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 619.0/990.0 = 0.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 90.0/54.0 = 1.67

mature (isoform content): 12.69% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.17% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 2052.0/129.0 = 15.91
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 571.0/31.0 = 18.42

mature (isoform content): 21.77% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.38% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 19.0/33.0 = 0.58
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10.0/8.0 = 1.25

mature (isoform content): 34.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.51% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 906.0/221.0 = 4.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 351.0/48.0 = 7.31

mature (isoform content): 27.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.84% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 179.0/41.0 = 4.37
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41.0/2.0 = 20.5

mature (isoform content): 18.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.65% (homogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 3.0/7.0 = 0.43
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6.0/1.0 = 6.0

mature (isoform content): 66.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.5% (heterogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 154.0/15.0 = 10.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35.0/4.0 = 8.75

mature (isoform content): 18.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.05% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 4.0/2.0 = 2.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 20.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 282.0/122.0 = 2.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 26.0/5.0 = 5.2

mature (isoform content): 8.44% (homogeneous)
star (isoform content): 3.94% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 362.0/112.0 = 3.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 60.0/10.0 = 6.0

mature (isoform content): 14.22% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.2% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 1234.0/1174.0 = 1.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 287.0/182.0 = 1.58

mature (isoform content): 18.87% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.42% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 160.0/5.0 = 32.0

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1817.0/123.0 = 14.77

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 290.0/401.0 = 0.72

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 139.0/13.0 = 10.69

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 800.0/82.0 = 9.76

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 468.0/35.0 = 13.37

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 307.0/76.0 = 4.04

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 9560.0/599.0 = 15.96

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 1160.0/181.0 = 6.41

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 1551.0/256.0 = 6.06

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 27.0/13.0 = 2.08

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 602.0/46.0 = 13.09

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 139.0/39.0 = 3.56

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 397.0/74.0 = 5.36

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 30.0/35.0 = 0.86

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 91.0/26.0 = 3.5

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ratio mature/star: 619.0/990.0 = 0.63

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ratio mature/star: 2052.0/129.0 = 15.91

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ratio mature/star: 19.0/33.0 = 0.58

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ratio mature/star: 906.0/221.0 = 4.1

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 179.0/41.0 = 4.37

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ratio mature/star: 4.0/2.0 = 2.0

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ratio mature/star: 282.0/122.0 = 2.31

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