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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-281

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 98.0/160.0 = 0.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 16.0/49.0 = 0.33

mature (isoform content): 14.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.44% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 5228.0/1203.0 = 4.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1198.0/255.0 = 4.7

mature (isoform content): 18.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.49% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 5.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)
star (isoform content): None

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 61.0/123.0 = 0.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10.0/37.0 = 0.27

mature (isoform content): 14.08% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.13% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 5974.0/3456.0 = 1.73
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1420.0/714.0 = 1.99

mature (isoform content): 19.2% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.12% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 6449.0/2941.0 = 2.19
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1690.0/657.0 = 2.57

mature (isoform content): 20.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.26% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 6942.0/3333.0 = 2.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1271.0/599.0 = 2.12

mature (isoform content): 15.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.23% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 4222.0/1716.0 = 2.46
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 621.0/214.0 = 2.9

mature (isoform content): 12.82% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.09% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 7984.0/6369.0 = 1.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1141.0/945.0 = 1.21

mature (isoform content): 12.5% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.92% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 11946.0/3865.0 = 3.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1076.0/395.0 = 2.72

mature (isoform content): 8.26% (homogeneous)
star (isoform content): 9.27% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 121.0/13.0 = 9.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15.0/1.0 = 15.0

mature (isoform content): 11.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.14% (homogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 9203.0/1770.0 = 5.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2652.0/513.0 = 5.17

mature (isoform content): 22.37% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.47% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 822.0/127.0 = 6.47
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 265.0/40.0 = 6.63

mature (isoform content): 24.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.95% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 12778.0/5227.0 = 2.44
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1478.0/721.0 = 2.05

mature (isoform content): 10.37% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.12% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 29.0/8.0 = 3.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/3.0 = 1.33

mature (isoform content): 12.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 27.27% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 6014.0/2713.0 = 2.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1466.0/585.0 = 2.51

mature (isoform content): 19.6% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.74% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 459.0/122.0 = 3.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 33.0/14.0 = 2.36

mature (isoform content): 6.71% (homogeneous)
star (isoform content): 10.29% (heterogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 894.0/271.0 = 3.3
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 187.0/52.0 = 3.6

mature (isoform content): 17.3% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.1% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 32.0/1.0 = 32.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10.0/1.0 = 10.0

mature (isoform content): 23.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 581.0/110.0 = 5.28
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 171.0/22.0 = 7.77

mature (isoform content): 22.74% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 505.0/633.0 = 0.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 54.0/84.0 = 0.64

mature (isoform content): 9.66% (homogeneous)
star (isoform content): 11.72% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 38.0/2.0 = 19.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18.0/1.0 = 18.0

mature (isoform content): 32.14% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 190.0/251.0 = 0.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35.0/44.0 = 0.8

mature (isoform content): 15.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.92% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 685.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 138.0/0.0 = None

mature (isoform content): 16.77% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 9639.0/3546.0 = 2.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 744.0/269.0 = 2.77

mature (isoform content): 7.17% (homogeneous)
star (isoform content): 7.05% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 8145.0/6412.0 = 1.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 674.0/578.0 = 1.17

mature (isoform content): 7.64% (homogeneous)
star (isoform content): 8.27% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 26.0/10.0 = 2.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/2.0 = 1.5

mature (isoform content): 10.34% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 98.0/160.0 = 0.61

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 5228.0/1203.0 = 4.35

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 5.0/0.0 = None

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 61.0/123.0 = 0.5

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 5974.0/3456.0 = 1.73

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ratio mature/star: 6449.0/2941.0 = 2.19

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ratio mature/star: 6942.0/3333.0 = 2.08

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ratio mature/star: 4222.0/1716.0 = 2.46

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 7984.0/6369.0 = 1.25

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 11946.0/3865.0 = 3.09

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ratio mature/star: 121.0/13.0 = 9.31

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eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 822.0/127.0 = 6.47

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embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 29.0/8.0 = 3.63

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 6014.0/2713.0 = 2.22

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 459.0/122.0 = 3.76

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ratio mature/star: 32.0/1.0 = 32.0

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ratio mature/star: 581.0/110.0 = 5.28

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ratio mature/star: 505.0/633.0 = 0.8

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