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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-305

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 315.0/12.0 = 26.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 75.0/5.0 = 15.0

mature (isoform content): 19.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 29.41% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1863.0/719.0 = 2.59
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 517.0/174.0 = 2.97

mature (isoform content): 21.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.48% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 866.0/898.0 = 0.96
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 346.0/245.0 = 1.41

mature (isoform content): 28.55% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.43% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 303.0/34.0 = 8.91
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 66.0/9.0 = 7.33

mature (isoform content): 17.89% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.93% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 3212.0/584.0 = 5.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1087.0/141.0 = 7.71

mature (isoform content): 25.28% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.45% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 2252.0/497.0 = 4.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 880.0/131.0 = 6.72

mature (isoform content): 28.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.86% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 1254.0/554.0 = 2.26
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 332.0/129.0 = 2.57

mature (isoform content): 20.93% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.89% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 4673.0/1525.0 = 3.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1117.0/277.0 = 4.03

mature (isoform content): 19.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.37% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 4762.0/1179.0 = 4.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1009.0/156.0 = 6.47

mature (isoform content): 17.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.69% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 3107.0/1991.0 = 1.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 401.0/102.0 = 3.93

mature (isoform content): 11.43% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.87% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 26.0/1.0 = 26.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11.0/3.0 = 3.67

mature (isoform content): 29.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 75.0% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 1129.0/337.0 = 3.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 342.0/76.0 = 4.5

mature (isoform content): 23.25% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.4% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 789.0/1513.0 = 0.52
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 128.0/255.0 = 0.5

mature (isoform content): 13.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.42% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 2150.0/993.0 = 2.17
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 398.0/123.0 = 3.24

mature (isoform content): 15.62% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.02% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 20.0/17.0 = 1.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/2.0 = 2.0

mature (isoform content): 16.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.53% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 338.0/158.0 = 2.14
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 99.0/22.0 = 4.5

mature (isoform content): 22.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.22% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 3044.0/2435.0 = 1.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 445.0/149.0 = 2.99

mature (isoform content): 12.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.77% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 2887.0/586.0 = 4.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 609.0/91.0 = 6.69

mature (isoform content): 17.42% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.44% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 15.0/32.0 = 0.47
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2.0/10.0 = 0.2

mature (isoform content): 11.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.81% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 1358.0/704.0 = 1.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 547.0/201.0 = 2.72

mature (isoform content): 28.71% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.21% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 1378.0/373.0 = 3.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 237.0/27.0 = 8.78

mature (isoform content): 14.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.75% (homogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 7.0/4.0 = 1.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 12.5% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 646.0/159.0 = 4.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 190.0/33.0 = 5.76

mature (isoform content): 22.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.19% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 38.0/10.0 = 3.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15.0/0.0 = None

mature (isoform content): 28.3% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 2801.0/1770.0 = 1.58
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 270.0/104.0 = 2.6

mature (isoform content): 8.79% (homogeneous)
star (isoform content): 5.55% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 1061.0/450.0 = 2.36
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 130.0/28.0 = 4.64

mature (isoform content): 10.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.86% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 2972.0/2766.0 = 1.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 844.0/576.0 = 1.47

mature (isoform content): 22.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.24% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 315.0/12.0 = 26.25

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1863.0/719.0 = 2.59

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 866.0/898.0 = 0.96

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 303.0/34.0 = 8.91

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 3212.0/584.0 = 5.5

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 2252.0/497.0 = 4.53

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 1254.0/554.0 = 2.26

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 4673.0/1525.0 = 3.06

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 4762.0/1179.0 = 4.04

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 3107.0/1991.0 = 1.56

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 26.0/1.0 = 26.0

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ratio mature/star: 1129.0/337.0 = 3.35

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 789.0/1513.0 = 0.52

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embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 20.0/17.0 = 1.18

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 338.0/158.0 = 2.14

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ratio mature/star: 15.0/32.0 = 0.47

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ratio mature/star: 1358.0/704.0 = 1.93

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