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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-306

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 516.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 206.0/0.0 = None

mature (isoform content): 28.53% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 4911.0/7.0 = 701.57
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1725.0/7.0 = 246.43

mature (isoform content): 25.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 600.0/2.0 = 300.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 464.0/8.0 = 58.0

mature (isoform content): 43.61% (heterogeneous)
star (isoform content): 80.0% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 545.0/1.0 = 545.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 268.0/3.0 = 89.33

mature (isoform content): 32.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 75.0% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 2071.0/5.0 = 414.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1082.0/3.0 = 360.67

mature (isoform content): 34.32% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.5% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 1365.0/1.0 = 1365.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 722.0/1.0 = 722.0

mature (isoform content): 34.6% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 1219.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 695.0/2.0 = 347.5

mature (isoform content): 36.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 5121.0/10.0 = 512.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4030.0/11.0 = 366.36

mature (isoform content): 44.04% (heterogeneous)
star (isoform content): 52.38% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 8637.0/1.0 = 8637.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3735.0/5.0 = 747.0

mature (isoform content): 30.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 83.33% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 6420.0/2.0 = 3210.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4025.0/4.0 = 1006.25

mature (isoform content): 38.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 66.67% (heterogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 109.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 639.0/1.0 = 639.0

mature (isoform content): 85.43% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 4552.0/4.0 = 1138.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1319.0/8.0 = 164.88

mature (isoform content): 22.47% (heterogeneous)
star (isoform content): 66.67% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 529.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 401.0/1.0 = 401.0

mature (isoform content): 43.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 4800.0/4.0 = 1200.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1983.0/1.0 = 1983.0

mature (isoform content): 29.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 144.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1007.0/1.0 = 1007.0

mature (isoform content): 87.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 887.0/1.0 = 887.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 412.0/0.0 = None

mature (isoform content): 31.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 3594.0/6.0 = 599.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1945.0/0.0 = None

mature (isoform content): 35.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 1403.0/6.0 = 233.83
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1541.0/0.0 = None

mature (isoform content): 52.34% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 351.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1642.0/0.0 = None

mature (isoform content): 82.39% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 1526.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 675.0/2.0 = 337.5

mature (isoform content): 30.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 1178.0/2.0 = 589.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 722.0/0.0 = None

mature (isoform content): 38.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 225.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 957.0/0.0 = None

mature (isoform content): 80.96% (heterogeneous)
star (isoform content): None

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 309.0/1.0 = 309.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 228.0/1.0 = 228.0

mature (isoform content): 42.46% (heterogeneous)
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ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 11.0/1.0 = 11.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9.0/1.0 = 9.0

mature (isoform content): 45.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 15935.0/2.0 = 7967.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3837.0/3.0 = 1279.0

mature (isoform content): 19.41% (heterogeneous)
star (isoform content): 60.0% (heterogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 3277.0/1.0 = 3277.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1310.0/0.0 = None

mature (isoform content): 28.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 979.0/9.0 = 108.78
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2033.0/8.0 = 254.13

mature (isoform content): 67.5% (heterogeneous)
star (isoform content): 47.06% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 516.0/0.0 = None

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 4911.0/7.0 = 701.57

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ratio mature/star: 600.0/2.0 = 300.0

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 545.0/1.0 = 545.0

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ratio mature/star: 2071.0/5.0 = 414.2

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ratio mature/star: 1365.0/1.0 = 1365.0

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ratio mature/star: 1219.0/0.0 = None

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