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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605	SRR4252605	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606	SRR4252606	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Mir-316

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 68.0/3.0 = 22.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 27.0/1.0 = 27.0

mature (isoform content): 28.42% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 231.0/32.0 = 7.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 161.0/3.0 = 53.67

mature (isoform content): 41.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.57% (homogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 75.0/10.0 = 7.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 29.0/2.0 = 14.5

mature (isoform content): 27.88% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 406.0/27.0 = 15.04
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 206.0/6.0 = 34.33

mature (isoform content): 33.66% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.18% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 276.0/31.0 = 8.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 216.0/11.0 = 19.64

mature (isoform content): 43.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 26.19% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 242.0/14.0 = 17.29
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 150.0/0.0 = None

mature (isoform content): 38.27% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 407.0/73.0 = 5.58
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 231.0/10.0 = 23.1

mature (isoform content): 36.21% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.05% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 600.0/27.0 = 22.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 253.0/2.0 = 126.5

mature (isoform content): 29.66% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.9% (homogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 1572.0/64.0 = 24.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 258.0/2.0 = 129.0

mature (isoform content): 14.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.03% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 469.0/29.0 = 16.17
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 226.0/6.0 = 37.67

mature (isoform content): 32.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.14% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 31.0/1.0 = 31.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28.0/1.0 = 28.0

mature (isoform content): 47.46% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 504.0/18.0 = 28.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 260.0/0.0 = None

mature (isoform content): 34.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 117.0/9.0 = 13.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 75.0/3.0 = 25.0

mature (isoform content): 39.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 2.0/3.0 = 0.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 33.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 50.0/3.0 = 16.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28.0/0.0 = None

mature (isoform content): 35.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 2.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 33.33% (heterogeneous)
star (isoform content): None

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 162.0/16.0 = 10.13
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 37.0/1.0 = 37.0

mature (isoform content): 18.59% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.88% (homogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 89.0/4.0 = 22.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35.0/1.0 = 35.0

mature (isoform content): 28.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 0.0/132.0 = 0.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/28.0 = 0.0

mature (isoform content): None
star (isoform content): 17.5% (heterogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 353.0/16.0 = 22.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 80.0/2.0 = 40.0

mature (isoform content): 18.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.11% (heterogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 455.0/30.0 = 15.17
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 145.0/2.0 = 72.5

mature (isoform content): 24.17% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.25% (homogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 68.0/3.0 = 22.67

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ratio mature/star: 231.0/32.0 = 7.22

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ratio mature/star: 75.0/10.0 = 7.5

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 406.0/27.0 = 15.04

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ratio mature/star: 276.0/31.0 = 8.9

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ratio mature/star: 242.0/14.0 = 17.29

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 407.0/73.0 = 5.58

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 600.0/27.0 = 22.22

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ratio mature/star: 455.0/30.0 = 15.17

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