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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-71

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 155.0/53.0 = 2.92
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 36.0/26.0 = 1.38

mature (isoform content): 18.85% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.91% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 7251.0/1072.0 = 6.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1787.0/236.0 = 7.57

mature (isoform content): 19.77% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.04% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 1401.0/111.0 = 12.62
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 351.0/28.0 = 12.54

mature (isoform content): 20.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.14% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 228.0/46.0 = 4.96
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41.0/33.0 = 1.24

mature (isoform content): 15.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 41.77% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 2531.0/605.0 = 4.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 661.0/153.0 = 4.32

mature (isoform content): 20.71% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.18% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 2022.0/462.0 = 4.38
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 646.0/122.0 = 5.3

mature (isoform content): 24.21% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.89% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 3573.0/325.0 = 10.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 688.0/67.0 = 10.27

mature (isoform content): 16.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.09% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 21026.0/3993.0 = 5.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3639.0/656.0 = 5.55

mature (isoform content): 14.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.11% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 4541.0/664.0 = 6.84
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 696.0/155.0 = 4.49

mature (isoform content): 13.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.93% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 13394.0/1494.0 = 8.97
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1117.0/123.0 = 9.08

mature (isoform content): 7.7% (homogeneous)
star (isoform content): 7.61% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 88.0/47.0 = 1.87
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35.0/13.0 = 2.69

mature (isoform content): 28.46% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.67% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 3687.0/401.0 = 9.19
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 969.0/94.0 = 10.31

mature (isoform content): 20.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.99% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 459.0/42.0 = 10.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 120.0/8.0 = 15.0

mature (isoform content): 20.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.0% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 4224.0/522.0 = 8.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 579.0/44.0 = 13.16

mature (isoform content): 12.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.77% (homogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 110.0/51.0 = 2.16
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 47.0/15.0 = 3.13

mature (isoform content): 29.94% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.73% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 799.0/91.0 = 8.78
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 234.0/17.0 = 13.76

mature (isoform content): 22.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.74% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 3899.0/465.0 = 8.38
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 297.0/26.0 = 11.42

mature (isoform content): 7.08% (homogeneous)
star (isoform content): 5.3% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 2958.0/422.0 = 7.01
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 509.0/81.0 = 6.28

mature (isoform content): 14.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.1% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 69.0/16.0 = 4.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 48.0/11.0 = 4.36

mature (isoform content): 41.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 40.74% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 2040.0/290.0 = 7.03
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 601.0/70.0 = 8.59

mature (isoform content): 22.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.44% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 519.0/119.0 = 4.36
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 68.0/14.0 = 4.86

mature (isoform content): 11.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.53% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 21.0/9.0 = 2.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 27.0/4.0 = 6.75

mature (isoform content): 56.25% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.77% (heterogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 201.0/73.0 = 2.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 46.0/14.0 = 3.29

mature (isoform content): 18.62% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.09% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 56.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 26.0/0.0 = None

mature (isoform content): 31.71% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 3008.0/407.0 = 7.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 277.0/20.0 = 13.85

mature (isoform content): 8.43% (homogeneous)
star (isoform content): 4.68% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 2076.0/370.0 = 5.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 244.0/23.0 = 10.61

mature (isoform content): 10.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.85% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 4893.0/445.0 = 11.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 863.0/92.0 = 9.38

mature (isoform content): 14.99% (heterogeneous)
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dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 155.0/53.0 = 2.92

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ratio mature/star: 1401.0/111.0 = 12.62

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 228.0/46.0 = 4.96

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 2531.0/605.0 = 4.18

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 2022.0/462.0 = 4.38

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 3573.0/325.0 = 10.99

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ratio mature/star: 21026.0/3993.0 = 5.27

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ratio mature/star: 4541.0/664.0 = 6.84

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ratio mature/star: 13394.0/1494.0 = 8.97

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