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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
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Bge-Mir-8

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 10266.0/543.0 = 18.91
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8555.0/55.0 = 155.55

mature (isoform content): 45.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.2% (homogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 30027.0/2951.0 = 10.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 16976.0/208.0 = 81.62

mature (isoform content): 36.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.58% (homogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 383.0/112.0 = 3.42
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 172.0/9.0 = 19.11

mature (isoform content): 30.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.44% (homogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 8940.0/796.0 = 11.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6601.0/51.0 = 129.43

mature (isoform content): 42.47% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.02% (homogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 22718.0/2937.0 = 7.74
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14915.0/230.0 = 64.85

mature (isoform content): 39.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.26% (homogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 22226.0/3559.0 = 6.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15169.0/271.0 = 55.97

mature (isoform content): 40.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.08% (homogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 18292.0/3975.0 = 4.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8884.0/224.0 = 39.66

mature (isoform content): 32.69% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.33% (homogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 117814.0/7865.0 = 14.98
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 54902.0/404.0 = 135.9

mature (isoform content): 31.79% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.89% (homogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 58923.0/4066.0 = 14.49
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 19252.0/189.0 = 101.86

mature (isoform content): 24.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.44% (homogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 92765.0/13367.0 = 6.94
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 22965.0/343.0 = 66.95

mature (isoform content): 19.84% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.5% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 211.0/26.0 = 8.12
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 71.0/0.0 = None

mature (isoform content): 25.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 24617.0/2623.0 = 9.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12913.0/193.0 = 66.91

mature (isoform content): 34.41% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.85% (homogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 700.0/536.0 = 1.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 397.0/41.0 = 9.68

mature (isoform content): 36.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.11% (homogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 61665.0/4428.0 = 13.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14637.0/223.0 = 65.64

mature (isoform content): 19.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.79% (homogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 164.0/28.0 = 5.86
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 37.0/1.0 = 37.0

mature (isoform content): 18.41% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.45% (homogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 16071.0/2024.0 = 7.94
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8026.0/133.0 = 60.35

mature (isoform content): 33.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.17% (homogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 7445.0/2431.0 = 3.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3051.0/120.0 = 25.43

mature (isoform content): 29.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.7% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 10424.0/1136.0 = 9.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4085.0/81.0 = 50.43

mature (isoform content): 28.15% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.66% (homogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 82.0/13.0 = 6.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 34.0/0.0 = None

mature (isoform content): 29.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 5813.0/1138.0 = 5.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4501.0/125.0 = 36.01

mature (isoform content): 43.64% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.9% (homogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 27374.0/2390.0 = 11.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9447.0/97.0 = 97.39

mature (isoform content): 25.66% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.9% (homogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 52.0/6.0 = 8.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 22.0/2.0 = 11.0

mature (isoform content): 29.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 8733.0/919.0 = 9.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4845.0/46.0 = 105.33

mature (isoform content): 35.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.77% (homogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 130.0/2457.0 = 0.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 69.0/498.0 = 0.14

mature (isoform content): 34.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.85% (heterogeneous)

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 28253.0/5342.0 = 5.29
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6841.0/156.0 = 43.85

mature (isoform content): 19.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.84% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 77601.0/6317.0 = 12.28
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18619.0/197.0 = 94.51

mature (isoform content): 19.35% (heterogeneous)
star (isoform content): 3.02% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 2047.0/220.0 = 9.3
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 904.0/21.0 = 43.05

mature (isoform content): 30.63% (heterogeneous)
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dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 10266.0/543.0 = 18.91

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 30027.0/2951.0 = 10.18

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ratio mature/star: 383.0/112.0 = 3.42

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 8940.0/796.0 = 11.23

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 22718.0/2937.0 = 7.74

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 22226.0/3559.0 = 6.25

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ratio mature/star: 18292.0/3975.0 = 4.6

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ratio mature/star: 117814.0/7865.0 = 14.98

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ratio mature/star: 92765.0/13367.0 = 6.94

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G	U	U	U	G	U	U	G	U	U	U	U	U	U	G	G	G	G	A	G	U	U	C	G	U	G	U	A	U	A	C	A	U	C	U	U	A	C	C	G	G	G	C	A	G	C	A	U	U	A	G	A	A	U	G	U	G	U	U	A	G	A	G	C	U	C	U	A	A	U	A	C	U	G	U	C	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	G	U	C	C	U	C	C	G	A	A	C	U	C	C	C	G	U	U	C	G	U	C	A	G	A	A	A	G	A	A	G	A	A

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