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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605	SRR4252605	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Mir-92-P14

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 41.0/40.0 = 1.02
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 70.0/9.0 = 7.78

mature (isoform content): 63.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.37% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1039.0/122.0 = 8.52
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 776.0/19.0 = 40.84

mature (isoform content): 42.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.48% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 618.0/47.0 = 13.15
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4207.0/10.0 = 420.7

mature (isoform content): 87.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.54% (heterogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 48.0/24.0 = 2.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 76.0/4.0 = 19.0

mature (isoform content): 61.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 464.0/63.0 = 7.37
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 320.0/12.0 = 26.67

mature (isoform content): 40.82% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.0% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 424.0/51.0 = 8.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 281.0/10.0 = 28.1

mature (isoform content): 39.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.39% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 632.0/54.0 = 11.7
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 319.0/7.0 = 45.57

mature (isoform content): 33.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.48% (heterogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 2443.0/343.0 = 7.12
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1604.0/54.0 = 29.7

mature (isoform content): 39.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.6% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 402.0/95.0 = 4.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 336.0/11.0 = 30.55

mature (isoform content): 45.53% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.38% (heterogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 849.0/230.0 = 3.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 448.0/12.0 = 37.33

mature (isoform content): 34.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.96% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 307.0/2.0 = 153.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 267.0/2.0 = 133.5

mature (isoform content): 46.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 50.0% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 300.0/85.0 = 3.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 417.0/14.0 = 29.79

mature (isoform content): 58.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.14% (heterogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 191.0/14.0 = 13.64
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 153.0/6.0 = 25.5

mature (isoform content): 44.48% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.0% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 521.0/77.0 = 6.77
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 255.0/11.0 = 23.18

mature (isoform content): 32.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.5% (heterogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 264.0/5.0 = 52.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 324.0/4.0 = 81.0

mature (isoform content): 55.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 44.44% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 146.0/23.0 = 6.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 63.0/4.0 = 15.75

mature (isoform content): 30.14% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.81% (heterogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 620.0/82.0 = 7.56
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 411.0/4.0 = 102.75

mature (isoform content): 39.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.65% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 766.0/45.0 = 17.02
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 395.0/8.0 = 49.38

mature (isoform content): 34.02% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.09% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 153.0/6.0 = 25.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 230.0/0.0 = None

mature (isoform content): 60.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 584.0/40.0 = 14.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 727.0/12.0 = 60.58

mature (isoform content): 55.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.08% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 153.0/60.0 = 2.55
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 102.0/10.0 = 10.2

mature (isoform content): 40.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 95.0/1.0 = 95.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 112.0/0.0 = None

mature (isoform content): 54.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 68.0/36.0 = 1.89
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 37.0/4.0 = 9.25

mature (isoform content): 35.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.0% (heterogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 52.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 29.0/0.0 = None

mature (isoform content): 35.8% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 421.0/45.0 = 9.36
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 181.0/6.0 = 30.17

mature (isoform content): 30.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.76% (heterogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 412.0/74.0 = 5.57
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 121.0/7.0 = 17.29

mature (isoform content): 22.7% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.64% (homogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 1708.0/154.0 = 11.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8382.0/30.0 = 279.4

mature (isoform content): 83.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.3% (heterogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 41.0/40.0 = 1.02

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 1039.0/122.0 = 8.52

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 618.0/47.0 = 13.15

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 48.0/24.0 = 2.0

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 464.0/63.0 = 7.37

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 424.0/51.0 = 8.31

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 632.0/54.0 = 11.7

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 2443.0/343.0 = 7.12

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 402.0/95.0 = 4.23

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 849.0/230.0 = 3.69

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 307.0/2.0 = 153.5

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 300.0/85.0 = 3.53

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 191.0/14.0 = 13.64

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 521.0/77.0 = 6.77

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 264.0/5.0 = 52.8

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 146.0/23.0 = 6.35

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 620.0/82.0 = 7.56

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 766.0/45.0 = 17.02

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ratio mature/star: 153.0/6.0 = 25.5

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ratio mature/star: 584.0/40.0 = 14.6

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 153.0/60.0 = 2.55

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ratio mature/star: 68.0/36.0 = 1.89

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ratio mature/star: 52.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 421.0/45.0 = 9.36

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