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control1_bge_SRR3666045	SRR3666045	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
control2_bge_SRR3666046	SRR3666046	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO1_bge_SRR3666047	SRR3666047	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
dicer-KO2_bge_SRR3666048	SRR3666048	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27883064
eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605	SRR4252605	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29020923
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Bge-Mir-92-P4

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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 35.0/6.0 = 5.83
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 75.0/3.0 = 25.0

mature (isoform content): 68.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 653.0/48.0 = 13.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1164.0/9.0 = 129.33

mature (isoform content): 64.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.79% (heterogeneous)

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 3040.0/169.0 = 17.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1804.0/16.0 = 112.75

mature (isoform content): 37.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.65% (homogeneous)

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 50.0/5.0 = 10.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 76.0/2.0 = 38.0

mature (isoform content): 60.32% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.57% (heterogeneous)

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 254.0/28.0 = 9.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 523.0/7.0 = 74.71

mature (isoform content): 67.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 196.0/19.0 = 10.32
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 508.0/6.0 = 84.67

mature (isoform content): 72.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 24.0% (heterogeneous)

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 236.0/15.0 = 15.73
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 709.0/1.0 = 709.0

mature (isoform content): 75.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 6.25% (homogeneous)

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 1242.0/143.0 = 8.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2796.0/18.0 = 155.33

mature (isoform content): 69.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.18% (heterogeneous)

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 255.0/39.0 = 6.54
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 475.0/2.0 = 237.5

mature (isoform content): 65.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.88% (homogeneous)

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 594.0/63.0 = 9.43
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 705.0/3.0 = 235.0

mature (isoform content): 54.27% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.55% (homogeneous)

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 244.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 163.0/15.0 = 10.87

mature (isoform content): 40.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 351.0/19.0 = 18.47
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 367.0/2.0 = 183.5

mature (isoform content): 51.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.52% (homogeneous)

eggs-1-non-fecundated_bge_SRR4252606

ratio mature/star: 88.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 157.0/1.0 = 157.0

mature (isoform content): 64.08% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

nymph-6-1_bge_SRR4252623

ratio mature/star: 289.0/13.0 = 22.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 481.0/0.0 = None

mature (isoform content): 62.47% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 268.0/16.0 = 16.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 131.0/14.0 = 9.36

mature (isoform content): 32.83% (heterogeneous)
star (isoform content): 46.67% (heterogeneous)

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 56.0/3.0 = 18.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 149.0/0.0 = None

mature (isoform content): 72.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo-day-6-1_bge_SRR4252613

ratio mature/star: 469.0/42.0 = 11.17
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 558.0/2.0 = 279.0

mature (isoform content): 54.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 4.55% (homogeneous)

eggs-2-non-fecundated_bge_SRR4252605

ratio mature/star: 417.0/6.0 = 69.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 572.0/9.0 = 63.56

mature (isoform content): 57.84% (heterogeneous)
star (isoform content): 60.0% (heterogeneous)

embryo-day-1-2_bge_SRR4252610

ratio mature/star: 125.0/15.0 = 8.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 161.0/4.0 = 40.25

mature (isoform content): 56.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.05% (heterogeneous)

embryo-day-6-2_bge_SRR4252614

ratio mature/star: 510.0/28.0 = 18.21
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 800.0/5.0 = 160.0

mature (isoform content): 61.07% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.15% (heterogeneous)

control2_bge_SRR3666046

ratio mature/star: 129.0/20.0 = 6.45
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 123.0/5.0 = 24.6

mature (isoform content): 48.81% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

embryo-day-0-2_bge_SRR4252608

ratio mature/star: 76.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 53.0/3.0 = 17.67

mature (isoform content): 41.09% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

control1_bge_SRR3666045

ratio mature/star: 40.0/3.0 = 13.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 65.0/0.0 = None

mature (isoform content): 61.9% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

ovaries-adult_bge_SRR060166

ratio mature/star: 42.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 37.0/0.0 = None

mature (isoform content): 46.84% (heterogeneous)
star (isoform content): None

nymph-5-1_bge_SRR4252621

ratio mature/star: 206.0/17.0 = 12.12
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 389.0/1.0 = 389.0

mature (isoform content): 65.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.56% (homogeneous)

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 140.0/17.0 = 8.24
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 384.0/2.0 = 192.0

mature (isoform content): 73.28% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.53% (heterogeneous)

embryo-day-2-2_bge_SRR4252611

ratio mature/star: 6476.0/741.0 = 8.74
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3639.0/67.0 = 54.31

mature (isoform content): 35.98% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.29% (homogeneous)

dicer-KO1_bge_SRR3666047

ratio mature/star: 35.0/6.0 = 5.83

embryo-day-13-2_bge_SRR4252616

ratio mature/star: 653.0/48.0 = 13.6

embryo-day-2-1_bge_SRR4252612

ratio mature/star: 3040.0/169.0 = 17.99

dicer-KO2_bge_SRR3666048

ratio mature/star: 50.0/5.0 = 10.0

nymph-3-1_bge_SRR4252620

ratio mature/star: 254.0/28.0 = 9.07

nymph-5-2_bge_SRR4252622

ratio mature/star: 196.0/19.0 = 10.32

nymph-6-2_bge_SRR4252624

ratio mature/star: 236.0/15.0 = 15.73

embryo-day-13-1_bge_SRR4252615

ratio mature/star: 1242.0/143.0 = 8.69

nymph-3-2_bge_SRR4252619

ratio mature/star: 255.0/39.0 = 6.54

nymph-1-1_bge_SRR4252617

ratio mature/star: 594.0/63.0 = 9.43

embryo-day-0-1_bge_SRR4252607

ratio mature/star: 244.0/0.0 = None

nymph-1-2_bge_SRR4252618

ratio mature/star: 351.0/19.0 = 18.47

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ratio mature/star: 88.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 289.0/13.0 = 22.23

embryo-day-1-1_bge_SRR4252609

ratio mature/star: 268.0/16.0 = 16.75

adult-female2_bge_SRR4252626

ratio mature/star: 56.0/3.0 = 18.67

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ratio mature/star: 469.0/42.0 = 11.17

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ratio mature/star: 417.0/6.0 = 69.5

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ratio mature/star: 125.0/15.0 = 8.33

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ratio mature/star: 510.0/28.0 = 18.21

control2_bge_SRR3666046

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ratio mature/star: 40.0/3.0 = 13.33

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ratio mature/star: 42.0/0.0 = None

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ratio mature/star: 206.0/17.0 = 12.12

adult-female1_bge_SRR4252625

ratio mature/star: 140.0/17.0 = 8.24

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