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Cbr-Bantam-P1a

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

wholeanimal-03_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1264790.0/10993.0 = 115.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 45702.0/453.0 = 100.89

mature (isoform content): 3.49% (homogeneous)
star (isoform content): 3.96% (homogeneous)

wholeanimal-14_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1011824.0/4852.0 = 208.54
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 38051.0/356.0 = 106.88

mature (isoform content): 3.62% (homogeneous)
star (isoform content): 6.84% (homogeneous)

wholeanimal-01_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 877857.0/6643.0 = 132.15
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 33422.0/396.0 = 84.4

mature (isoform content): 3.67% (homogeneous)
star (isoform content): 5.63% (homogeneous)

wholeanimal-12_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1074859.0/5690.0 = 188.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 38370.0/429.0 = 89.44

mature (isoform content): 3.45% (homogeneous)
star (isoform content): 7.01% (homogeneous)

wholeanimal-05_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1555898.0/9014.0 = 172.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 54080.0/502.0 = 107.73

mature (isoform content): 3.36% (homogeneous)
star (isoform content): 5.28% (homogeneous)

males-200individuals_cbr_SRR2979640

ratio mature/star: 53195.0/214.0 = 248.57
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 13729.0/6.0 = 2288.17

mature (isoform content): 20.51% (heterogeneous)
star (isoform content): 2.73% (homogeneous)

wholeanimal-08_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1194882.0/9138.0 = 130.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41532.0/401.0 = 103.57

mature (isoform content): 3.36% (homogeneous)
star (isoform content): 4.2% (homogeneous)

wholeanimal-16_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1051530.0/5219.0 = 201.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 38925.0/507.0 = 76.78

mature (isoform content): 3.57% (homogeneous)
star (isoform content): 8.85% (homogeneous)

wholeanimal-02_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1348807.0/12758.0 = 105.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 50233.0/601.0 = 83.58

mature (isoform content): 3.59% (homogeneous)
star (isoform content): 4.5% (homogeneous)

wholeanimal-06_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1362675.0/8426.0 = 161.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 49695.0/463.0 = 107.33

mature (isoform content): 3.52% (homogeneous)
star (isoform content): 5.21% (homogeneous)

wholeanimal-07_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1624843.0/10155.0 = 160.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 56277.0/448.0 = 125.62

mature (isoform content): 3.35% (homogeneous)
star (isoform content): 4.23% (homogeneous)

wholeanimal-04_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1332654.0/7209.0 = 184.86
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41739.0/244.0 = 171.06

mature (isoform content): 3.04% (homogeneous)
star (isoform content): 3.27% (homogeneous)

wholeanimal-11_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1241716.0/6789.0 = 182.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 43673.0/530.0 = 82.4

mature (isoform content): 3.4% (homogeneous)
star (isoform content): 7.24% (homogeneous)

early-embryo_cbr_SRR585539

ratio mature/star: 95195.0/245.0 = 388.55
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 802.0/1.0 = 802.0

mature (isoform content): 0.84% (homogeneous)
star (isoform content): 0.41% (homogeneous)

young-adult-male_cbr_SRR585540

ratio mature/star: 305219.0/405.0 = 753.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7305.0/29.0 = 251.9

mature (isoform content): 2.34% (homogeneous)
star (isoform content): 6.68% (homogeneous)

wholeanimal-09_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1318807.0/9986.0 = 132.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 46519.0/523.0 = 88.95

mature (isoform content): 3.41% (homogeneous)
star (isoform content): 4.98% (homogeneous)

wholeanimal-15_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 945373.0/4321.0 = 218.79
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 34752.0/358.0 = 97.07

mature (isoform content): 3.55% (homogeneous)
star (isoform content): 7.65% (homogeneous)

wholeanimal-10_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1115641.0/6921.0 = 161.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 39006.0/426.0 = 91.56

mature (isoform content): 3.38% (homogeneous)
star (isoform content): 5.8% (homogeneous)

young-adult-hermaphrodite_cbr_SRR585538

ratio mature/star: 667351.0/3448.0 = 193.55
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 26164.0/190.0 = 137.71

mature (isoform content): 3.77% (homogeneous)
star (isoform content): 5.22% (homogeneous)

wholeanimal-13_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 989882.0/4599.0 = 215.24
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 36328.0/346.0 = 104.99

mature (isoform content): 3.54% (homogeneous)
star (isoform content): 7.0% (homogeneous)

wholeanimal-03_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1264790.0/10993.0 = 115.05

wholeanimal-14_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1011824.0/4852.0 = 208.54

wholeanimal-01_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 877857.0/6643.0 = 132.15

wholeanimal-12_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1074859.0/5690.0 = 188.9

wholeanimal-05_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1555898.0/9014.0 = 172.61

males-200individuals_cbr_SRR2979640

ratio mature/star: 53195.0/214.0 = 248.57

wholeanimal-08_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 1194882.0/9138.0 = 130.76

wholeanimal-16_cbr_PRJNA1030349

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wholeanimal-13_cbr_PRJNA1030349

ratio mature/star: 989882.0/4599.0 = 215.24

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