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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

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ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5907.01/322.84 = 18.3

mature (isoform content): 1.23% (homogeneous)
star (isoform content): 8.84% (homogeneous)

young-adult-male_cel_SRR585537

ratio mature/star: 113886.0/2009.0 = 56.69
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1483.0/245.0 = 6.05

mature (isoform content): 1.29% (homogeneous)
star (isoform content): 10.87% (heterogeneous)

wild-type_cel_SRR6112539

ratio mature/star: 719041.0/2998.0 = 239.84
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8415.0/97.0 = 86.75

mature (isoform content): 1.16% (homogeneous)
star (isoform content): 3.13% (homogeneous)

dauer-stage_cel_PRJNA176827

ratio mature/star: 674486.0/5260.0 = 128.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9572.0/180.0 = 53.18

mature (isoform content): 1.4% (homogeneous)
star (isoform content): 3.31% (homogeneous)

mixed-stages_cel_PRJNA176827

ratio mature/star: 1072059.0/2576.0 = 416.17
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10523.0/209.0 = 50.35

mature (isoform content): 0.97% (homogeneous)
star (isoform content): 7.5% (homogeneous)

young-adult-hermaphrodite_cel_SRR585535

ratio mature/star: 1016810.0/5193.0 = 195.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14146.0/636.0 = 22.24

mature (isoform content): 1.37% (homogeneous)
star (isoform content): 10.91% (heterogeneous)

early-embryo_cel_SRR585536

ratio mature/star: 3556.0/205.0 = 17.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 58.0/10.0 = 5.8

mature (isoform content): 1.6% (homogeneous)
star (isoform content): 4.65% (homogeneous)

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ratio mature/star: 674486.0/5260.0 = 128.23

mixed-stages_cel_PRJNA176827

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young-adult-hermaphrodite_cel_SRR585535

ratio mature/star: 1016810.0/5193.0 = 195.8

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ratio mature/star: 3556.0/205.0 = 17.35

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