reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

References
Tissue	Paper	Accesion
blood_cfa_SRR3587076	SRR3587076	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
heart_cfa_SRR3587077	SRR3587077	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
liver_cfa_SRR3587078	SRR3587078	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
testis_cfa_SRR3587081	SRR3587081	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
ovary_cfa_SRR3587082	SRR3587082	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
lung_cfa_SRR3587083	SRR3587083	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
kidney_cfa_SRR3587085	SRR3587085	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
skin_cfa_SRR3587086	SRR3587086	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27119849
historic-skin2_cfa_SRR8090323	SRR8090323	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31361744
historic-skin1_cfa_SRR8090324	SRR8090324	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31361744
ancient-muscle_cfa_SRR8090326	SRR8090326	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31361744
ancient-liver_cfa_SRR8090327	SRR8090327	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31361744
ancient-cartilage_cfa_SRR8090328	SRR8090328	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31361744

Cfa-Mir-188-P3

Relative expression

Relative expression

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 71.13/2.59 = 27.5

Global results

ratio mature/star: 71.13/2.59 = 27.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9.05/1.29 = 7.0

mature (isoform content): 11.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

Show details:

liver_cfa_SRR3587078

ratio mature/star: 110.0/4.0 = 27.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14.0/2.0 = 7.0

mature (isoform content): 11.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

liver_cfa_SRR3587078

ratio mature/star: 110.0/4.0 = 27.5

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	1.29
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		52	33.62
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		54	34.92
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	1.94
G	U	G	G	A	G	A	A	G	A	A	U	G	A	A	C	U	G	C	U	C	C	U	U	C	U	C	C	U	A	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	G	A	A	U	U	C	U	C	A	A	A	G	C	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	C	A	G	G	A	G	G	C	U	G	A	G	C	C	U	U	G	U	C	G	U	C	A	C	A	A	A	C	C	U	U	C

download reads

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		2	1.29
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		52	33.62
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		54	34.92
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	1.94
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		4	2.59
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		5	3.23
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		3	1.94
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	G	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		1	0.65
G	U	G	G	A	G	A	A	G	A	A	U	G	A	A	C	U	G	C	U	C	C	U	U	C	U	C	C	U	A	U	A	C	C	C	A	U	U	G	C	A	U	A	U	C	G	G	A	G	U	U	G	U	G	A	A	U	U	C	U	C	A	A	A	G	C	A	C	C	U	C	C	U	G	U	G	U	G	C	A	U	G	G	A	U	U	A	C	A	G	G	A	G	G	C	U	G	A	G	C	C	U	U	G	U	C	G	U	C	A	C	A	A	A	C	C	U	U	C

download reads

download reads