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Cfa-Mir-199-P2-v2

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

cerebellum_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 2674.0/403.0 = 6.64
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 580.0/33.0 = 17.58

mature (isoform content): 17.82% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.57% (homogeneous)

historic-skin1_cfa_SRR8090324

ratio mature/star: 12.0/2.0 = 6.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 10.0/1.0 = 10.0

mature (isoform content): 45.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

blood_cfa_SRR3587076

ratio mature/star: 31.0/18.0 = 1.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 19.0/8.0 = 2.38

mature (isoform content): 38.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.77% (heterogeneous)

testis_cfa_SRR3587081

ratio mature/star: 91497.0/55450.0 = 1.65
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 25895.0/6020.0 = 4.3

mature (isoform content): 22.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.79% (homogeneous)

historic-skin2_cfa_SRR8090323

ratio mature/star: 60.0/10.0 = 6.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 29.0/6.0 = 4.83

mature (isoform content): 32.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.5% (heterogeneous)

testis2_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 7444.0/1136.0 = 6.55
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1414.0/103.0 = 13.73

mature (isoform content): 15.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.31% (homogeneous)

kidney2_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 19382.0/3816.0 = 5.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4532.0/390.0 = 11.62

mature (isoform content): 18.95% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.27% (homogeneous)

lung_cfa_SRR3587083

ratio mature/star: 92920.0/47672.0 = 1.95
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 28212.0/5904.0 = 4.78

mature (isoform content): 23.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.02% (heterogeneous)

liver_cfa_SRR3587078

ratio mature/star: 14865.0/14.0 = 1061.79
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2914.0/3.0 = 971.33

mature (isoform content): 16.39% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.65% (heterogeneous)

heart_cfa_SRR3587077

ratio mature/star: 39446.0/12383.0 = 3.19
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9046.0/1159.0 = 7.81

mature (isoform content): 18.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.56% (homogeneous)

hypothalamus_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 4146.0/591.0 = 7.02
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 935.0/56.0 = 16.7

mature (isoform content): 18.4% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.66% (homogeneous)

ovary_cfa_SRR3587082

ratio mature/star: 214271.0/69438.0 = 3.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 52328.0/7192.0 = 7.28

mature (isoform content): 19.63% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.39% (homogeneous)

cortex_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 19073.0/1745.0 = 10.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3358.0/155.0 = 21.66

mature (isoform content): 14.97% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.16% (homogeneous)

kidney_cfa_SRR3587085

ratio mature/star: 34498.0/2514.0 = 13.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12556.0/331.0 = 37.93

mature (isoform content): 26.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.63% (heterogeneous)

skin_cfa_SRR3587086

ratio mature/star: 10880.0/4199.0 = 2.59
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4257.0/589.0 = 7.23

mature (isoform content): 28.12% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.3% (heterogeneous)

cerebellum_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 2674.0/403.0 = 6.64

historic-skin1_cfa_SRR8090324

ratio mature/star: 12.0/2.0 = 6.0

blood_cfa_SRR3587076

ratio mature/star: 31.0/18.0 = 1.72

testis_cfa_SRR3587081

ratio mature/star: 91497.0/55450.0 = 1.65

historic-skin2_cfa_SRR8090323

ratio mature/star: 60.0/10.0 = 6.0

testis2_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 7444.0/1136.0 = 6.55

kidney2_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 19382.0/3816.0 = 5.08

lung_cfa_SRR3587083

ratio mature/star: 92920.0/47672.0 = 1.95

liver_cfa_SRR3587078

ratio mature/star: 14865.0/14.0 = 1061.79

heart_cfa_SRR3587077

ratio mature/star: 39446.0/12383.0 = 3.19

hypothalamus_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 4146.0/591.0 = 7.02

ovary_cfa_SRR3587082

ratio mature/star: 214271.0/69438.0 = 3.09

cortex_cfa_PRJNA432546

ratio mature/star: 19073.0/1745.0 = 10.93

kidney_cfa_SRR3587085

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skin_cfa_SRR3587086

ratio mature/star: 10880.0/4199.0 = 2.59

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	G	U	U	C	A	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.4	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	G	U	U	C	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.18	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	G	U	U	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1191	124.34	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	G	A	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	0.33	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	334	36.67	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.38	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.2	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	G	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.1	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	G	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.1	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	G	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.06	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.48	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	U	A	G	A	C	U	A	U	C	C	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.1	Cfa-Mir-199-P2-v1, Cfa-Mir-199-P2-v3
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