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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

ratio mature/star: 51952.0/6.0 = 8658.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2059.0/0.0 = None

mature (isoform content): 3.81% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

C-robusta-8-days-post-amputation_cin_SRR3953086

ratio mature/star: 67109.0/18.0 = 3728.28
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3932.0/3.0 = 1310.67

mature (isoform content): 5.53% (homogeneous)
star (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation2_cin_SRR3953078

ratio mature/star: 13175.0/6.0 = 2195.83
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 657.0/1.0 = 657.0

mature (isoform content): 4.75% (homogeneous)
star (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

gastrula_cin_SRR038844

ratio mature/star: 8.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 45478.0/26.0 = 1749.15

mature (isoform content): 99.98% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation2_cin_SRR3953084

ratio mature/star: 56875.0/3.0 = 18958.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2463.0/0.0 = None

mature (isoform content): 4.15% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation1_cin_SRR3953077

ratio mature/star: 35765.0/15.0 = 2384.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2252.0/1.0 = 2252.0

mature (isoform content): 5.92% (homogeneous)
star (isoform content): 6.25% (homogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation3_cin_SRR3953085

ratio mature/star: 79015.0/38.0 = 2079.34
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3516.0/11.0 = 319.64

mature (isoform content): 4.26% (homogeneous)
star (isoform content): 22.45% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation1_cin_SRR3953080

ratio mature/star: 29234.0/7.0 = 4176.29
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1616.0/0.0 = None

mature (isoform content): 5.24% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

late-embryo_cin_SRR014355

ratio mature/star: 543.0/2.0 = 271.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8598.0/3.0 = 2866.0

mature (isoform content): 94.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 60.0% (heterogeneous)

larva_cin_SRR038843

ratio mature/star: 8.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 127069.0/6.0 = 21178.17

mature (isoform content): 99.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation3_cin_SRR3953079

ratio mature/star: 39084.0/11.0 = 3553.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2331.0/0.0 = None

mature (isoform content): 5.63% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation1_cin_SRR3953083

ratio mature/star: 27057.0/16.0 = 1691.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2313.0/0.0 = None

mature (isoform content): 7.88% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation2_cin_SRR3953081

ratio mature/star: 62390.0/6.0 = 10398.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4202.0/2.0 = 2101.0

mature (isoform content): 6.31% (homogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	U	C	U	G	G	U	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	14.36
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	U	C	U	G	G	U	G	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	3.02
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	U	C	U	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	6.2
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	U	C	U	G	C	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	7	23.76
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	U	C	U	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	3.1
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	G	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.29
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	C	A	G	U	G	G	A	G	G	U	A	A	A	G	A	U	G	G	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8	2.32
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