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both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

ratio mature/star: 185.0/25.0 = 7.4
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mature (isoform content): 7.04% (homogeneous)
star (isoform content): 7.41% (homogeneous)

C-robusta-8-days-post-amputation_cin_SRR3953086

ratio mature/star: 138.0/127.0 = 1.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11.0/27.0 = 0.41

mature (isoform content): 7.38% (homogeneous)
star (isoform content): 17.53% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation2_cin_SRR3953078

ratio mature/star: 133.0/27.0 = 4.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 17.0/5.0 = 3.4

mature (isoform content): 11.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 15.63% (heterogeneous)

gastrula_cin_SRR038844

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
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mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): None

C-robusta-3-days-post-amputation2_cin_SRR3953084

ratio mature/star: 83.0/18.0 = 4.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9.0/2.0 = 4.5

mature (isoform content): 9.78% (homogeneous)
star (isoform content): 10.0% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation1_cin_SRR3953077

ratio mature/star: 280.0/36.0 = 7.78
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 33.0/21.0 = 1.57

mature (isoform content): 10.54% (heterogeneous)
star (isoform content): 36.84% (heterogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation3_cin_SRR3953085

ratio mature/star: 56.0/70.0 = 0.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/10.0 = 0.3

mature (isoform content): 5.08% (homogeneous)
star (isoform content): 12.5% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation1_cin_SRR3953080

ratio mature/star: 86.0/36.0 = 2.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 15.0/9.0 = 1.67

mature (isoform content): 14.85% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

C-robusta-0-days-immediately-post-amputation3_cin_SRR3953079

ratio mature/star: 130.0/72.0 = 1.81
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 20.0/12.0 = 1.67

mature (isoform content): 13.33% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.29% (heterogeneous)

C-robusta-3-days-post-amputation1_cin_SRR3953083

ratio mature/star: 126.0/45.0 = 2.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/7.0 = 0.57

mature (isoform content): 3.08% (homogeneous)
star (isoform content): 13.46% (heterogeneous)

C-robusta-1-day-post-amputation2_cin_SRR3953081

ratio mature/star: 281.0/89.0 = 3.16
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12.0/5.0 = 2.4

mature (isoform content): 4.1% (homogeneous)
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C-robusta-1-day-post-amputation3_cin_SRR3953082

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