References | ||
Tissue | Paper | Accesion |
liver_cli_PRJNA628933 | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33248553/ | |
pectoral-muscles_cli_PRJNA641159 | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34221709/ | |
ovaries-plus2_cli_SRR89611678 | NA | |
testes-plus2_cli_SRR89611679 | NA | |
total-animal_cli | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21775315 | |
milkexosomes_cli_SRR66321843 | NA | |
milkexosomes_cli_SRR66321844 | NA | |
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both truncated mismatch | 5' elongated mismatch | 3' elongated mismatch | both elongated mismatch | 5' truncated mismatch | 3' truncated mismatch | canonical mismatch |
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- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | A | G | G | U | A | G | U | A | G | G | U | U | G | U | A | U | A | G | U | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 29 | 62.67 | Cli-Let-7-P1d, Cli-Let-7-P1c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | A | G | G | U | A | G | U | A | G | G | U | U | G | U | A | U | A | G | U | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 4.32 | Cli-Let-7-P1d, Cli-Let-7-P1c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | A | G | G | U | A | G | U | A | G | G | U | U | G | U | A | U | A | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 4.32 | Cli-Let-7-P1d, Cli-Let-7-P1c, ... | ||
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G | G | G | C | G | A | G | A | C | C | C | C | U | G | U | A | C | U | G | C | U | C | U | G | U | G | G | A | G | G | U | G | A | G | G | U | A | G | U | A | G | G | U | U | G | U | A | U | A | G | U | U | U | G | G | U | G | G | G | A | G | G | G | A | U | U | U | G | A | U | C | C | C | A | U | U | U | C | A | G | G | U | G | A | U | A | A | C | U | A | U | A | C | A | G | U | C | U | A | U | U | G | C | C | U | U | C | C | U | U | A | A | A | G | A | G | C | A | G | C | A | A | A | C | C | C | A | C | C | A | G | A | G | G | A | C | U | G | |||||
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