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Cpo-Mir-1-P3

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total-animal_cpo_SRR3097338	SRR3097338	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26733575
oocyte_cpo_SRX14786361	SRX14786361	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38532500/
oocyte_cpo_SRX14786362	SRX14786362	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38532500/
oocyte_cpo_SRX14786363	SRX14786363	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38532500/
oocyte_cpo_SRX14786364	SRX14786364	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38532500/
whole-juvenile_cpo_SRX1527562	SRX1527562	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26733575/
blood_cpo_SRX8985545	SRX8985545	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33061944/
blood_cpo_SRX8985546	SRX8985546	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33061944/
blood_cpo_SRX8985547	SRX8985547	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33061944/
blood_cpo_SRX8985548	SRX8985548	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33061944/