reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

References
Tissue	Paper	Accesion
female-germline_csc_SRR5602513	SRR5602513	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma_csc_SRR5602514	SRR5602514	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-germline_csc_SRR5958548	SRR5958548	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-prosoma_csc_SRR5958578	SRR5958578	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-prosoma2_csc_SRR5958582	SRR5958582	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma1_csc_SRR5958583	SRR5958583	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-prosoma2_csc_SRR5958586	SRR5958586	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/

Csc-Mir-71-P15

Relative expression

Relative expression

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 10.7/30.56 = 0.35

Global results

ratio mature/star: 10.7/30.56 = 0.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.06/14.52 = 0.21

mature (isoform content): 22.22% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.2% (heterogeneous)

Show details:

female-germline_csc_SRR5602513

ratio mature/star: 14.0/40.0 = 0.35
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/19.0 = 0.21

mature (isoform content): 22.22% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.2% (heterogeneous)

female-germline_csc_SRR5602513

ratio mature/star: 14.0/40.0 = 0.35

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	C	A	C	U	A	C	C	U	U	G	U	C	U	U	U	G	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		14	10.7	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		9	6.88	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		16	12.23	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		9	6.88	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		6	4.58	Csc-Mir-71-P14
C	U	U	G	G	A	A	U	G	A	U	A	U	A	A	C	U	G	G	U	A	U	U	A	G	U	U	C	U	G	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	G	U	G	A	U	U	U	U	U	A	A	A	A	U	C	A	U	C	U	C	A	C	U	A	C	C	U	U	G	U	C	U	U	U	G	A	C	G	G	A	A	A	U	A	A	U	A	C	A	U	U	U	U	U	G	C	A	U	C	U	U	A	A	A	U	U	U	G

download reads

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	C	A	C	U	A	C	C	U	U	G	U	C	U	U	U	G	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		14	10.7	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		9	6.88	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		16	12.23	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		9	6.88	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		6	4.58	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	C	U	C	A	C	U	A	C	C	U	U	G	U	C	U	U	U	G	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		4	3.06	Csc-Mir-71-P14
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-		19	14.52	Csc-Mir-71-P14
C	U	U	G	G	A	A	U	G	A	U	A	U	A	A	C	U	G	G	U	A	U	U	A	G	U	U	C	U	G	U	G	A	A	A	G	A	C	A	U	G	G	G	U	A	G	U	G	A	G	A	U	G	U	G	A	U	U	U	U	U	A	A	A	A	U	C	A	U	C	U	C	A	C	U	A	C	C	U	U	G	U	C	U	U	U	G	A	C	G	G	A	A	A	U	A	A	U	A	C	A	U	U	U	U	U	G	C	A	U	C	U	U	A	A	A	U	U	U	G

download reads

download reads