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Dre-Mir-199-P3-v3

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

gut-male_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 9236.0/1813.0 = 5.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 902.0/711.0 = 1.27

mature (isoform content): 8.9% (homogeneous)
star (isoform content): 28.17% (heterogeneous)

brain-male_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 1139.0/460.0 = 2.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 126.0/140.0 = 0.9

mature (isoform content): 9.96% (homogeneous)
star (isoform content): 23.33% (heterogeneous)

testis_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 6234.0/955.0 = 6.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 697.0/589.0 = 1.18

mature (isoform content): 10.06% (heterogeneous)
star (isoform content): 38.15% (heterogeneous)

liver-female_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 19762.0/3728.0 = 5.3
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2439.0/1910.0 = 1.28

mature (isoform content): 10.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.88% (heterogeneous)

eye_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 3805.0/3005.0 = 1.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 412.0/811.0 = 0.51

mature (isoform content): 9.77% (homogeneous)
star (isoform content): 21.25% (heterogeneous)

ovary_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 6335.0/461.0 = 13.74
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 879.0/127.0 = 6.92

mature (isoform content): 12.18% (heterogeneous)
star (isoform content): 21.6% (heterogeneous)

brain-female_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 1535.0/575.0 = 2.67
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 150.0/144.0 = 1.04

mature (isoform content): 8.9% (homogeneous)
star (isoform content): 20.03% (heterogeneous)

embryo_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 33191.0/2277.0 = 14.58
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3701.0/902.0 = 4.1

mature (isoform content): 10.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.37% (heterogeneous)

gut-female_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 21374.0/3579.0 = 5.97
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2540.0/1431.0 = 1.77

mature (isoform content): 10.62% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.56% (heterogeneous)

heart_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 23971.0/13875.0 = 1.73
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2785.0/2274.0 = 1.22

mature (isoform content): 10.41% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.08% (heterogeneous)

liver-male_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 20599.0/3863.0 = 5.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2559.0/1459.0 = 1.75

mature (isoform content): 11.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 27.41% (heterogeneous)

gut-male_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 9236.0/1813.0 = 5.09

brain-male_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 1139.0/460.0 = 2.48

testis_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 6234.0/955.0 = 6.53

liver-female_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 19762.0/3728.0 = 5.3

eye_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 3805.0/3005.0 = 1.27

ovary_dre_PRJNA245824

ratio mature/star: 6335.0/461.0 = 13.74

brain-female_dre_PRJNA245824

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embryo_dre_PRJNA245824

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ratio mature/star: 21374.0/3579.0 = 5.97

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ratio mature/star: 20599.0/3863.0 = 5.33

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	67	10.64	Dre-Mir-199-P2a-v3, Dre-Mir-199-P2b-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	474	75.45	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	121	19.05	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	19	2.24	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2b-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	C	A	U	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.21	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	275	39.83	Dre-Mir-199-P2a-v3, Dre-Mir-199-P2b-v1, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	G	U	A	G	U	C	C	G	C	A	C	A	U	U	G	G	U	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	25	4.35	Dre-Mir-199-P3-v1, Dre-Mir-199-P3-v2
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	G	U	A	G	U	C	C	G	C	A	C	A	U	U	G	G	U	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	13	1.83	Dre-Mir-199-P3-v1, Dre-Mir-199-P3-v2
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	25	3.31	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.21	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.03	Dre-Mir-199-P2a-v3, Dre-Mir-199-P2b-v1, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	U	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	0.34	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	U	U	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	0.16	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	U	U	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6	0.6	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	U	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.2	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.21	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.1	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	U	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	16	2.23	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	G	U	G	U	U	C	A	G	A	C	U	A	C	C	U	G	C	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.49	Dre-Mir-199-P2a-v1, Dre-Mir-199-P2a-v2, ...
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