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PSSM-GM_eca_ERX1533210	ERX1533210	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
platysma_eca_ERX1533212	ERX1533212	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
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heart_eca_ERX1533214	ERX1533214	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
healthy-GM_eca_ERX1533215	ERX1533215	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
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bone_eca_ERX1533218	ERX1533218	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
cartilage_eca_ERX1533219	ERX1533219	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27782799
testis_eca_SRX1101199	SRX1101199	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27060702/
milk_eca_SRX11204340	SRX11204340	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36963568/
endometrium-category-I-in-follicular-phase_eca_SRX17629828	SRX17629828	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37743390/
endometrium-category-III-in-follicular-phase_eca_SRX17629830	SRX17629830	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37743390/
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endometrium-25-28-day-of-pregnancy_eca_SRX17629835	SRX17629835	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37743390/
endometrium-category-IIA-in-follicular-phase_eca_SRX17629839	SRX17629839	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37743390/
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immature-testis_eca_SRX2986679	SRX2986679	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32209208/
mature-testis_eca_SRX2986682	SRX2986682	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32209208/
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kidney_eca_SRX3639625	SRX3639625	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30451897/
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splenius_eca_SRX6884780	SRX6884780	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31869634/
triceps-brachii_eca_SRX6884786	SRX6884786	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31869634/
uterus_eca_SRX7267345	SRX7267345	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31936511/
uterine-fluid_eca_SRX7267346	SRX7267346	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31936511/
embryo_eca_SRX7267354	SRX7267354	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31936511/
yolk-sac_eca_SRX7267356	SRX7267356	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31936511/
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Eca-Mir-140-P2-v1

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

endometrium-category-III-in-follicular-phase_eca_SRX17629830

ratio mature/star: 6066.0/347.0 = 17.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3617.0/197.0 = 18.36

mature (isoform content): 37.35% (heterogeneous)
star (isoform content): 36.21% (heterogeneous)

triceps-brachii_eca_SRX6884786

ratio mature/star: 8070.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8941.0/2.0 = 4470.5

mature (isoform content): 52.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

endometrium-category-I-in-follicular-phase_eca_SRX17629828

ratio mature/star: 2697.0/153.0 = 17.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1451.0/107.0 = 13.56

mature (isoform content): 34.98% (heterogeneous)
star (isoform content): 41.15% (heterogeneous)

masseter_eca_ERX1533213

ratio mature/star: 13617.0/151.0 = 90.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5777.0/36.0 = 160.47

mature (isoform content): 29.79% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.25% (heterogeneous)

endometrium-category-IIA-in-follicular-phase_eca_SRX17629839

ratio mature/star: 16331.0/954.0 = 17.12
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9016.0/551.0 = 16.36

mature (isoform content): 35.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 36.61% (heterogeneous)

endometrium_eca_SRX3350096

ratio mature/star: 6119.0/33.0 = 185.42
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3141.0/11.0 = 285.55

mature (isoform content): 33.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.0% (heterogeneous)

bone_eca_ERX1533218

ratio mature/star: 21633.0/147.0 = 147.16
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6558.0/53.0 = 123.74

mature (isoform content): 23.26% (heterogeneous)
star (isoform content): 26.5% (heterogeneous)

lung_eca_SRX8490070

ratio mature/star: 5388.0/179.0 = 30.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3956.0/131.0 = 30.2

mature (isoform content): 42.34% (heterogeneous)
star (isoform content): 42.26% (heterogeneous)

kidney_eca_SRX3639625

ratio mature/star: 2391.0/73.0 = 32.75
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1476.0/38.0 = 38.84

mature (isoform content): 38.17% (heterogeneous)
star (isoform content): 34.23% (heterogeneous)

heart_eca_ERX1533214

ratio mature/star: 12190.0/111.0 = 109.82
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5409.0/25.0 = 216.36

mature (isoform content): 30.73% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.38% (heterogeneous)

cartilage_eca_ERX1533219

ratio mature/star: 31589.0/96.0 = 329.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 11513.0/56.0 = 205.59

mature (isoform content): 26.71% (heterogeneous)
star (isoform content): 36.84% (heterogeneous)

PSSM-GM_eca_ERX1533210

ratio mature/star: 2091.0/91.0 = 22.98
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1700.0/50.0 = 34.0

mature (isoform content): 44.84% (heterogeneous)
star (isoform content): 35.46% (heterogeneous)

endometrium-category-IIB-in-follicular-phase_eca_SRX17629842

ratio mature/star: 4335.0/228.0 = 19.01
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2396.0/130.0 = 18.43

mature (isoform content): 35.6% (heterogeneous)
star (isoform content): 36.31% (heterogeneous)

horse-whole_eca_SRX3639631

ratio mature/star: 941.0/32.0 = 29.41
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 530.0/8.0 = 66.25

mature (isoform content): 36.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

yolk-sac_eca_SRX7267356

ratio mature/star: 3.0/2.0 = 1.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/0.0 = None

mature (isoform content): 50.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

healthy-GM_eca_ERX1533215

ratio mature/star: 725.0/44.0 = 16.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 486.0/15.0 = 32.4

mature (isoform content): 40.13% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.42% (heterogeneous)

endometrium-25-28-day-of-pregnancy_eca_SRX17629835

ratio mature/star: 3140.0/236.0 = 13.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1635.0/167.0 = 9.79

mature (isoform content): 34.24% (heterogeneous)
star (isoform content): 41.44% (heterogeneous)

uterus_eca_SRX7267345

ratio mature/star: 26.0/10.0 = 2.6
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 21.0/0.0 = None

mature (isoform content): 44.68% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

embryo_eca_SRX7267354

ratio mature/star: 14.0/4.0 = 3.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/1.0 = 1.0

mature (isoform content): 6.67% (homogeneous)
star (isoform content): 20.0% (heterogeneous)

testis_eca_SRX1101199

ratio mature/star: 5493.0/63.0 = 87.19
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6499.0/41.0 = 158.51

mature (isoform content): 54.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 39.42% (heterogeneous)

milk_eca_SRX11204340

ratio mature/star: 701.0/2.0 = 350.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 241.0/17.0 = 14.18

mature (isoform content): 25.58% (heterogeneous)
star (isoform content): 89.47% (heterogeneous)

endometrium-category-I-in-mid-luteal-phase_eca_SRX17629832

ratio mature/star: 15058.0/370.0 = 40.7
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8377.0/259.0 = 32.34

mature (isoform content): 35.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 41.18% (heterogeneous)

longissimus-dorsi_eca_SRX6884776

ratio mature/star: 6450.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7792.0/1.0 = 7792.0

mature (isoform content): 54.71% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

uterine-fluid_eca_SRX7267346

ratio mature/star: 60.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 13.0/0.0 = None

mature (isoform content): 17.81% (heterogeneous)
star (isoform content): None

mature-testis_eca_SRX2986682

ratio mature/star: 4512.0/615.0 = 7.34
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3172.0/281.0 = 11.29

mature (isoform content): 41.28% (heterogeneous)
star (isoform content): 31.36% (heterogeneous)

immature-testis_eca_SRX2986679

ratio mature/star: 109193.0/11337.0 = 9.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 49029.0/5771.0 = 8.5

mature (isoform content): 30.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 33.73% (heterogeneous)

liver_eca_ERX1533216

ratio mature/star: 7943.0/32.0 = 248.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1578.0/11.0 = 143.45

mature (isoform content): 16.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 25.58% (heterogeneous)

gluteus-medius_eca_SRX17790672

ratio mature/star: 10717.0/339.0 = 31.61
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4775.0/161.0 = 29.66

mature (isoform content): 30.82% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.2% (heterogeneous)

platysma_eca_ERX1533212

ratio mature/star: 1277.0/2.0 = 638.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 742.0/4.0 = 185.5

mature (isoform content): 36.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 66.67% (heterogeneous)

splenius_eca_SRX6884780

ratio mature/star: 13653.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 12867.0/0.0 = None

mature (isoform content): 48.52% (heterogeneous)
star (isoform content): None

endometrium-category-III-in-follicular-phase_eca_SRX17629830

ratio mature/star: 6066.0/347.0 = 17.48

triceps-brachii_eca_SRX6884786

ratio mature/star: 8070.0/0.0 = None

endometrium-category-I-in-follicular-phase_eca_SRX17629828

ratio mature/star: 2697.0/153.0 = 17.63

masseter_eca_ERX1533213

ratio mature/star: 13617.0/151.0 = 90.18

endometrium-category-IIA-in-follicular-phase_eca_SRX17629839

ratio mature/star: 16331.0/954.0 = 17.12

endometrium_eca_SRX3350096

ratio mature/star: 6119.0/33.0 = 185.42

bone_eca_ERX1533218

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lung_eca_SRX8490070

ratio mature/star: 5388.0/179.0 = 30.1

kidney_eca_SRX3639625

ratio mature/star: 2391.0/73.0 = 32.75

heart_eca_ERX1533214

ratio mature/star: 12190.0/111.0 = 109.82

cartilage_eca_ERX1533219

ratio mature/star: 31589.0/96.0 = 329.05

PSSM-GM_eca_ERX1533210

ratio mature/star: 2091.0/91.0 = 22.98

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ratio mature/star: 4335.0/228.0 = 19.01

horse-whole_eca_SRX3639631

ratio mature/star: 941.0/32.0 = 29.41

yolk-sac_eca_SRX7267356

ratio mature/star: 3.0/2.0 = 1.5

healthy-GM_eca_ERX1533215

ratio mature/star: 725.0/44.0 = 16.48

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ratio mature/star: 3140.0/236.0 = 13.31

uterus_eca_SRX7267345

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embryo_eca_SRX7267354

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mature-testis_eca_SRX2986682

ratio mature/star: 4512.0/615.0 = 7.34

immature-testis_eca_SRX2986679

ratio mature/star: 109193.0/11337.0 = 9.63

liver_eca_ERX1533216

ratio mature/star: 7943.0/32.0 = 248.22

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