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Gmo-Mir-1388

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

intestine_gmo_SRR2039404

ratio mature/star: 280.0/111.0 = 2.52
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 70.0/76.0 = 0.92

mature (isoform content): 20.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 40.64% (heterogeneous)

spleen_gmo_SRR2039437

ratio mature/star: 4951.0/2122.0 = 2.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1148.0/1019.0 = 1.13

mature (isoform content): 18.82% (heterogeneous)
star (isoform content): 32.44% (heterogeneous)

white-muscle_gmo_SRR2039265

ratio mature/star: 34.0/37.0 = 0.92
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8.0/16.0 = 0.5

mature (isoform content): 19.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 30.19% (heterogeneous)

gills_gmo_SRR2039267

ratio mature/star: 1553.0/1265.0 = 1.23
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 284.0/327.0 = 0.87

mature (isoform content): 15.46% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.54% (heterogeneous)

brain_gmo_SRR2039435

ratio mature/star: 146.0/47.0 = 3.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 25.0/28.0 = 0.89

mature (isoform content): 14.62% (heterogeneous)
star (isoform content): 37.33% (heterogeneous)

skin_gmo_SRR2039332

ratio mature/star: 457.0/397.0 = 1.15
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 64.0/121.0 = 0.53

mature (isoform content): 12.28% (heterogeneous)
star (isoform content): 23.36% (heterogeneous)

head-kidney_gmo_SRR2039266

ratio mature/star: 1237.0/746.0 = 1.66
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 267.0/312.0 = 0.86

mature (isoform content): 17.75% (heterogeneous)
star (isoform content): 29.49% (heterogeneous)

liver_gmo_SRR2039436

ratio mature/star: 471.0/160.0 = 2.94
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 122.0/107.0 = 1.14

mature (isoform content): 20.57% (heterogeneous)
star (isoform content): 40.07% (heterogeneous)

intestine_gmo_SRR2039404

ratio mature/star: 280.0/111.0 = 2.52

spleen_gmo_SRR2039437

ratio mature/star: 4951.0/2122.0 = 2.33

white-muscle_gmo_SRR2039265

ratio mature/star: 34.0/37.0 = 0.92

gills_gmo_SRR2039267

ratio mature/star: 1553.0/1265.0 = 1.23

brain_gmo_SRR2039435

ratio mature/star: 146.0/47.0 = 3.11

skin_gmo_SRR2039332

ratio mature/star: 457.0/397.0 = 1.15

head-kidney_gmo_SRR2039266

ratio mature/star: 1237.0/746.0 = 1.66

liver_gmo_SRR2039436

ratio mature/star: 471.0/160.0 = 2.94

Reads

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References
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