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female-germline-2_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-germline-1_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-soma-2_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-soma-1_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
female-soma-1_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
male-soma-2_hme_PRJNA386859	PRJNA386859	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29203920/
adult-rosina_hme_SRR062600	SRR062600	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21266089/