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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

ovary_loc_SRR2473341

ratio mature/star: 123000.0/77.0 = 1597.4
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 116786.0/32.0 = 3649.56

mature (isoform content): 48.7% (heterogeneous)
star (isoform content): 29.36% (heterogeneous)

brain_loc_SRR2473356

ratio mature/star: 1813156.0/1742.0 = 1040.85
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1014079.0/395.0 = 2567.29

mature (isoform content): 35.87% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.48% (heterogeneous)

brain_loc_SRR2473355

ratio mature/star: 340959.0/280.0 = 1217.71
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 209699.0/68.0 = 3083.81

mature (isoform content): 38.08% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.54% (heterogeneous)

ovary_loc_SRR2473350

ratio mature/star: 105314.0/285.0 = 369.52
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 57670.0/92.0 = 626.85

mature (isoform content): 35.38% (heterogeneous)
star (isoform content): 24.4% (heterogeneous)

ovary_loc_SRR2473349

ratio mature/star: 40439.0/101.0 = 400.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 24701.0/41.0 = 602.46

mature (isoform content): 37.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.87% (heterogeneous)

heart_loc_SRR2473346

ratio mature/star: 826017.0/878.0 = 940.79
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 484489.0/223.0 = 2172.6

mature (isoform content): 36.97% (heterogeneous)
star (isoform content): 20.25% (heterogeneous)

heart_loc_SRR2473345

ratio mature/star: 146706.0/162.0 = 905.59
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 93903.0/46.0 = 2041.37

mature (isoform content): 39.03% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.12% (heterogeneous)

testis_loc_SRR2473354

ratio mature/star: 51496.0/35.0 = 1471.31
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 36286.0/14.0 = 2591.86

mature (isoform content): 41.34% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.57% (heterogeneous)

testis_loc_SRR2473360

ratio mature/star: 1050404.0/1113.0 = 943.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 552054.0/250.0 = 2208.22

mature (isoform content): 34.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.34% (heterogeneous)

ovary_loc_SRR2473226

ratio mature/star: 20697.0/11.0 = 1881.55
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 21755.0/14.0 = 1553.93

mature (isoform content): 51.25% (heterogeneous)
star (isoform content): 56.0% (heterogeneous)

testis_loc_SRR2473353

ratio mature/star: 6698.0/9.0 = 744.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 5448.0/1.0 = 5448.0

mature (isoform content): 44.85% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.0% (heterogeneous)

heart_loc_SRR2473358

ratio mature/star: 838876.0/855.0 = 981.14
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 674293.0/197.0 = 3422.81

mature (isoform content): 44.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.73% (heterogeneous)

heart_loc_SRR2473357

ratio mature/star: 151030.0/172.0 = 878.08
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 130152.0/35.0 = 3718.63

mature (isoform content): 46.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.91% (heterogeneous)

testis_loc_SRR2473359

ratio mature/star: 187994.0/226.0 = 831.83
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 109291.0/64.0 = 1707.67

mature (isoform content): 36.76% (heterogeneous)
star (isoform content): 22.07% (heterogeneous)

ovary_loc_SRR2473341

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