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Mdo-Mir-1544-P2c

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 153.89/12.63 = 12.19
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 63.35/12.54 = 5.05

mature (isoform content): 29.16% (heterogeneous)
star (isoform content): 49.84% (heterogeneous)

kidney_mdo_SRR553590

ratio mature/star: 78.0/4.0 = 19.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41.0/8.0 = 5.13

mature (isoform content): 34.45% (heterogeneous)
star (isoform content): 66.67% (heterogeneous)

heart_mdo_SRR553589

ratio mature/star: 235.0/24.0 = 9.79
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41.0/18.0 = 2.28

mature (isoform content): 14.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 42.86% (heterogeneous)

brain_mdo_SRR553587

ratio mature/star: 105.0/19.0 = 5.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 43.0/21.0 = 2.05

mature (isoform content): 29.05% (heterogeneous)
star (isoform content): 52.5% (heterogeneous)

cerebellum_mdo_SRR553588

ratio mature/star: 698.0/26.0 = 26.85
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 62.0/13.0 = 4.77

mature (isoform content): 8.16% (homogeneous)
star (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

testes_mdo_SRR553591

ratio mature/star: 40.0/7.0 = 5.71
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 81.0/10.0 = 8.1

mature (isoform content): 66.94% (heterogeneous)
star (isoform content): 58.82% (heterogeneous)

kidney_mdo_SRR553590

ratio mature/star: 78.0/4.0 = 19.5

heart_mdo_SRR553589

ratio mature/star: 235.0/24.0 = 9.79

brain_mdo_SRR553587

ratio mature/star: 105.0/19.0 = 5.53

cerebellum_mdo_SRR553588

ratio mature/star: 698.0/26.0 = 26.85

testes_mdo_SRR553591

ratio mature/star: 40.0/7.0 = 5.71

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.25	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	U	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6	0.78	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	U	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	49	7.58	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	U	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.12	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	U	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.5	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.12	Mdo-Mir-1544-P2o
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.1	Mdo-Mir-1544-P2a, Mdo-Mir-1544-P2i, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	11	1.29	Mdo-Mir-1544-P2a, Mdo-Mir-1544-P2i, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	14	1.69	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	991	125.32	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	84	12.26	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	34	8.52	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	16	4.08	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	G	U	G	C	C	C	U	G	G	G	A	U	A	G	A	U	A	A	G	U	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.12	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	U	U	A	G	C	A	C	C	U	G	A	C	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	40	5.06	Mdo-Mir-1544-P2d, Mdo-Mir-1544-P2e, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	U	A	C	C	A	C	U	U	A	G	C	A	C	C	U	G	A	C	C	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	0.47	Mdo-Mir-1544-P2d, Mdo-Mir-1544-P2e, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	G	U	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.28	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	U	U	C	U	A	U	C	C	A	U	G	G	C	A	C	U	G	G	U	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.26	Mdo-Mir-1544-P2i, Mdo-Mir-1544-P2j, ...
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References
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