References | ||
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cerebellum_mdo_SRR553588 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23034410 | |
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kidney_mdo_SRR553590 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23034410 | |
testes_mdo_SRR553591 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23034410 | |
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both truncated | 5' elongated | 3' elongated | both elongated | 5' truncated | 3' truncated | canonical |
both truncated mismatch | 5' elongated mismatch | 3' elongated mismatch | both elongated mismatch | 5' truncated mismatch | 3' truncated mismatch | canonical mismatch |
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C | U | C | C | U | A | C | U | C | U | U | C | G | A | C | C | U | C | C | A | G | G | U | G | C | C | C | G | A | C | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | U | C | G | U | G | U | U | C | U | C | U | C | U | U | U | C | G | G | U | A | A | A | U | C | C | U | U | U | C | C | U | C | U | C | A | C | U | G | U | U | G | G | A | C | A | U | C | U | C | G | G | A | U | U | C | U | G | C | G | A | C | U | G | U | C | C | C | C | A | |||||
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- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7 | 0.87 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | U | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 11 | 1.37 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 34 | 4.22 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | 0.37 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | U | U | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5c, Mdo-Mir-7398-P5d | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | U | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | U | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5 | 0.62 | Mdo-Mir-7398-P5c, Mdo-Mir-7398-P5d | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5c, Mdo-Mir-7398-P5d | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | 0.5 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 38 | 4.72 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 171 | 21.23 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.25 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3 | 0.37 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | C | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | U | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.12 | Mdo-Mir-7398-P5a, Mdo-Mir-7398-P5c, ... | ||
C | U | C | C | U | A | C | U | C | U | U | C | G | A | C | C | U | C | C | A | G | G | U | G | C | C | C | G | A | C | U | G | U | G | U | G | G | A | G | G | U | A | A | G | G | A | A | C | U | A | C | G | U | C | G | U | G | U | U | C | U | C | U | C | U | U | U | C | G | G | U | A | A | A | U | C | C | U | U | U | C | C | U | C | U | C | A | C | U | G | U | U | G | G | A | C | A | U | C | U | C | G | G | A | U | U | C | U | G | C | G | A | C | U | G | U | C | C | C | C | A | |||||
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