References | ||
Tissue | Paper | Accesion |
cerebellum_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
testis_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
kidney_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
hypothalamus_cfa_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
cortex_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
wholebrain_ocu_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
testis2_cfa_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
heart_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
cortex_cfa_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
kidney2_cfa_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
testis_ocu_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
cerebellum_cfa_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
hypothalamus_bta_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
kidney_ocu_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
heart_ocu_PRJNA432546 | https://www.biorxiv.org/content/early/2018/01/31/257006 | |
total-animal_ocu | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26733575 | |
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both truncated | 5' elongated | 3' elongated | both elongated | 5' truncated | 3' truncated | canonical |
both truncated mismatch | 5' elongated mismatch | 3' elongated mismatch | both elongated mismatch | 5' truncated mismatch | 3' truncated mismatch | canonical mismatch |
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U | U | C | C | G | G | A | U | C | A | A | G | A | U | C | A | G | A | G | A | C | U | C | U | G | C | C | C | U | C | C | G | U | G | U | U | C | A | C | A | G | C | G | G | A | C | C | U | U | G | A | U | U | U | A | A | U | G | U | C | A | U | A | C | A | A | U | U | A | A | G | G | C | A | C | G | C | G | G | U | G | A | A | U | G | C | C | A | A | G | A | G | C | G | G | A | G | U | C | U | A | C | G | G | C | U | G | C | G | C | A | C | G | A | A | G | G | A | C | |||||
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