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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

ruditapes_rph_SRX1841372

ratio mature/star: 127899.0/346.0 = 369.65
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2499.0/28.0 = 89.25

mature (isoform content): 1.92% (homogeneous)
star (isoform content): 7.49% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841367

ratio mature/star: 3005.0/14.0 = 214.64
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 130.0/2.0 = 65.0

mature (isoform content): 4.15% (homogeneous)
star (isoform content): 12.5% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841371

ratio mature/star: 158182.0/443.0 = 357.07
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2462.0/25.0 = 98.48

mature (isoform content): 1.53% (homogeneous)
star (isoform content): 5.34% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219565

ratio mature/star: 127135.0/192.0 = 662.16
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18932.0/81.0 = 233.73

mature (isoform content): 12.96% (heterogeneous)
star (isoform content): 29.67% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX4946220

ratio mature/star: 279680.0/238.0 = 1175.13
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 22657.0/19.0 = 1192.47

mature (isoform content): 7.49% (homogeneous)
star (isoform content): 7.39% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841369

ratio mature/star: 149485.0/594.0 = 251.66
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3465.0/39.0 = 88.85

mature (isoform content): 2.27% (homogeneous)
star (isoform content): 6.16% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841370

ratio mature/star: 74140.0/428.0 = 173.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1892.0/35.0 = 54.06

mature (isoform content): 2.49% (homogeneous)
star (isoform content): 7.56% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841368

ratio mature/star: 20728.0/69.0 = 300.41
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 444.0/4.0 = 111.0

mature (isoform content): 2.1% (homogeneous)
star (isoform content): 5.48% (homogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219567

ratio mature/star: 95194.0/253.0 = 376.26
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 7211.0/67.0 = 107.63

mature (isoform content): 7.04% (homogeneous)
star (isoform content): 20.94% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219566

ratio mature/star: 110493.0/287.0 = 384.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 8010.0/95.0 = 84.32

mature (isoform content): 6.76% (homogeneous)
star (isoform content): 24.87% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX4946218

ratio mature/star: 147428.0/126.0 = 1170.06
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 18652.0/14.0 = 1332.29

mature (isoform content): 11.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.0% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219564

ratio mature/star: 63345.0/140.0 = 452.46
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6681.0/103.0 = 64.86

mature (isoform content): 9.54% (homogeneous)
star (isoform content): 42.39% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219563

ratio mature/star: 103654.0/198.0 = 523.51
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 13224.0/40.0 = 330.6

mature (isoform content): 11.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 16.81% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219562

ratio mature/star: 72559.0/200.0 = 362.8
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 9696.0/41.0 = 236.49

mature (isoform content): 11.79% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.01% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX18219561

ratio mature/star: 130440.0/243.0 = 536.79
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 23225.0/96.0 = 241.93

mature (isoform content): 15.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 28.32% (heterogeneous)

ruditapes_rph_SRX1841372

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ruditapes_rph_SRX18219565

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ruditapes_rph_SRX4946220

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