References | ||
| Tissue | Paper | Accesion |
| ruditapes_rph_SRX18219561 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219562 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219563 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219564 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219565 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219566 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
| ruditapes_rph_SRX18219567 | https://doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106624 | |
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| ruditapes_rph_SRX4946218 | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33850162/ | |
| ruditapes_rph_SRX4946220 | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33850162/ | |
Legend | ||||||
both truncated | 5' elongated | 3' elongated | both elongated | 5' truncated | 3' truncated | canonical |
both truncated mismatch | 5' elongated mismatch | 3' elongated mismatch | both elongated mismatch | 5' truncated mismatch | 3' truncated mismatch | canonical mismatch |
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| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | U | U | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 399 | 61.56 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 21 | 3.24 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | C | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | 0.62 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 124 | 19.13 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | 0.62 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 17 | 2.62 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 30 | 4.63 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 11 | 1.7 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 15 | 2.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | A | U | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5 | 0.77 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o66 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2582 | 398.34 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 138 | 21.29 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | A | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 0.31 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | C | G | A | G | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64 | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | C | G | A | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1 | 0.15 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | A | A | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | 0.62 | Rph-Mir-2-o63, Rph-Mir-2-o64, ... | ||
| C | A | G | C | A | G | U | G | G | A | G | G | G | G | A | U | A | C | A | U | U | G | U | C | A | A | C | G | A | G | G | C | A | U | C | U | A | A | G | U | G | G | C | U | U | U | G | A | U | G | U | G | U | A | G | U | G | U | U | A | U | U | A | U | C | G | U | A | U | C | A | C | A | G | C | C | A | G | C | U | U | U | G | A | U | G | A | G | C | U | U | G | G | G | G | C | A | A | U | C | U | G | U | U | A | G | U | C | A | G | C | A | A | U | A | A | U | A | A | |||||
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