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Sme-Mir-281

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

ago2-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 8351.0/1456.0 = 5.74
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41051.0/202.0 = 203.22

mature (isoform content): 83.1% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.18% (heterogeneous)

whole-animals-irradiated_sme

ratio mature/star: 160.0/164.0 = 0.98
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2387.0/17.0 = 140.41

mature (isoform content): 93.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.39% (homogeneous)

section-4_sme_SRR12426756

ratio mature/star: 84.0/50.0 = 1.68
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1031.0/11.0 = 93.73

mature (isoform content): 92.47% (heterogeneous)
star (isoform content): 18.03% (heterogeneous)

section-2_sme_SRR12426760

ratio mature/star: 126.0/127.0 = 0.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1511.0/15.0 = 100.73

mature (isoform content): 92.3% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.56% (heterogeneous)

section-5_sme_SRR12426755

ratio mature/star: 104.0/120.0 = 0.87
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1272.0/10.0 = 127.2

mature (isoform content): 92.44% (heterogeneous)
star (isoform content): 7.69% (homogeneous)

section-11_sme_SRR12426759

ratio mature/star: 113.0/117.0 = 0.97
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1091.0/11.0 = 99.18

mature (isoform content): 90.61% (heterogeneous)
star (isoform content): 8.59% (homogeneous)

section-6_sme_SRR12426754

ratio mature/star: 37.0/73.0 = 0.51
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 491.0/15.0 = 32.73

mature (isoform content): 92.99% (heterogeneous)
star (isoform content): 17.05% (heterogeneous)

section-8_sme_SRR12426752

ratio mature/star: 125.0/115.0 = 1.09
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1710.0/17.0 = 100.59

mature (isoform content): 93.19% (heterogeneous)
star (isoform content): 12.88% (heterogeneous)

gfp-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 2199.0/649.0 = 3.39
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 19623.0/73.0 = 268.81

mature (isoform content): 89.92% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.11% (heterogeneous)

section-7_sme_SRR12426753

ratio mature/star: 61.0/84.0 = 0.73
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 567.0/11.0 = 51.55

mature (isoform content): 90.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.58% (heterogeneous)

whole-animals_sme

ratio mature/star: 955.0/36.0 = 26.53
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4043.0/20.0 = 202.15

mature (isoform content): 80.89% (heterogeneous)
star (isoform content): 35.71% (heterogeneous)

whole-animal-WT_sme

ratio mature/star: 4334.0/990.0 = 4.38
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 25396.0/152.0 = 167.08

mature (isoform content): 85.42% (heterogeneous)
star (isoform content): 13.31% (heterogeneous)

section-1_sme_SRR12426761

ratio mature/star: 160.0/164.0 = 0.98
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2387.0/17.0 = 140.41

mature (isoform content): 93.72% (heterogeneous)
star (isoform content): 9.39% (homogeneous)

section-9_sme_SRR12426751

ratio mature/star: 98.0/72.0 = 1.36
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1173.0/8.0 = 146.63

mature (isoform content): 92.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.0% (heterogeneous)

dicer-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 4289.0/1092.0 = 3.93
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 35814.0/135.0 = 265.29

mature (isoform content): 89.31% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.0% (heterogeneous)

pharynx-section-12_sme_SRR12426758

ratio mature/star: 111.0/68.0 = 1.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1424.0/16.0 = 89.0

mature (isoform content): 92.77% (heterogeneous)
star (isoform content): 19.05% (heterogeneous)

section-10_sme_SRR12426750

ratio mature/star: 312.0/297.0 = 1.05
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4530.0/52.0 = 87.12

mature (isoform content): 93.56% (heterogeneous)
star (isoform content): 14.9% (heterogeneous)

section-3_sme_SRR12426757

ratio mature/star: 155.0/127.0 = 1.22
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1908.0/7.0 = 272.57

mature (isoform content): 92.49% (heterogeneous)
star (isoform content): 5.22% (homogeneous)

ago1-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 3868.0/709.0 = 5.46
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 41778.0/83.0 = 503.35

mature (isoform content): 91.53% (heterogeneous)
star (isoform content): 10.48% (heterogeneous)

ago2-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 8351.0/1456.0 = 5.74

whole-animals-irradiated_sme

ratio mature/star: 160.0/164.0 = 0.98

section-4_sme_SRR12426756

ratio mature/star: 84.0/50.0 = 1.68

section-2_sme_SRR12426760

ratio mature/star: 126.0/127.0 = 0.99

section-5_sme_SRR12426755

ratio mature/star: 104.0/120.0 = 0.87

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ratio mature/star: 113.0/117.0 = 0.97

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ratio mature/star: 37.0/73.0 = 0.51

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ratio mature/star: 111.0/68.0 = 1.63

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ago1-KO_sme_PRJNA646861

ratio mature/star: 3868.0/709.0 = 5.46

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