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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

early-embryos-0-5d_tca_SRR089661

ratio mature/star: 64.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 76.0/5.0 = 15.2

mature (isoform content): 54.29% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

female-soma-1_tca_SRR5615774

ratio mature/star: 1370.0/92.0 = 14.89
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 26042.0/25521.0 = 1.02

mature (isoform content): 95.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.64% (heterogeneous)

female-germline-2_tca_SRR5615777

ratio mature/star: 706.0/8.0 = 88.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14101.0/4226.0 = 3.34

mature (isoform content): 95.23% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.81% (heterogeneous)

embryos-8-16h_tca_SRR1687590

ratio mature/star: 2385.0/230.0 = 10.37
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 146.0/30.0 = 4.87

mature (isoform content): 5.77% (homogeneous)
star (isoform content): 11.54% (heterogeneous)

embryos-34-48h_tca_SRR1687594

ratio mature/star: 35274.0/650.0 = 54.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1418.0/11.0 = 128.91

mature (isoform content): 3.86% (homogeneous)
star (isoform content): 1.66% (homogeneous)

adult-individuals_tca_SRR089660

ratio mature/star: 40217.0/368.0 = 109.29
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 25147.0/8572.0 = 2.93

mature (isoform content): 38.47% (heterogeneous)
star (isoform content): 95.88% (heterogeneous)

oocytes_tca_SRR1687586-87

ratio mature/star: 478.0/9.0 = 53.11
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 418.0/25.0 = 16.72

mature (isoform content): 46.65% (heterogeneous)
star (isoform content): 73.53% (heterogeneous)

embryos-16-20h_tca_SRR1687591

ratio mature/star: 4236.0/538.0 = 7.87
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 99.0/7.0 = 14.14

mature (isoform content): 2.28% (homogeneous)
star (isoform content): 1.28% (homogeneous)

embryos-0-5h_tca_SRR1687588-89

ratio mature/star: 470.0/6.0 = 78.33
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 215.0/55.0 = 3.91

mature (isoform content): 31.39% (heterogeneous)
star (isoform content): 90.16% (heterogeneous)

female-germline-1_tca_SRR5615776

ratio mature/star: 76.0/5.0 = 15.2
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1351.0/1434.0 = 0.94

mature (isoform content): 94.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.65% (heterogeneous)

female-soma-2_tca_SRR5615775

ratio mature/star: 7757.0/170.0 = 45.63
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 143291.0/54335.0 = 2.64

mature (isoform content): 94.86% (heterogeneous)
star (isoform content): 99.69% (heterogeneous)

embryos-24-34h_tca_SRR1687593

ratio mature/star: 31347.0/1219.0 = 25.72
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 882.0/15.0 = 58.8

mature (isoform content): 2.74% (homogeneous)
star (isoform content): 1.22% (homogeneous)

early-embryos-0-5d_tca_SRR089661

ratio mature/star: 64.0/0.0 = None

female-soma-1_tca_SRR5615774

ratio mature/star: 1370.0/92.0 = 14.89

female-germline-2_tca_SRR5615777

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embryos-8-16h_tca_SRR1687590

ratio mature/star: 2385.0/230.0 = 10.37

embryos-34-48h_tca_SRR1687594

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Reads

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	U	C	U	U	A	C	C	G	G	G	C	A	G	C	A	U	U	C	G	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	45	48.23
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