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Xla-Mir-140-P2b-v1

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 56740.29/107.41 = 528.27
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 6121.82/154.6 = 39.6

mature (isoform content): 9.74% (homogeneous)
star (isoform content): 59.01% (heterogeneous)

stage-56_xla_SRR2147031

ratio mature/star: 45572.0/95.0 = 479.71
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3006.0/51.0 = 58.94

mature (isoform content): 6.19% (homogeneous)
star (isoform content): 34.93% (heterogeneous)

stage-34-36_xla_SRR2147030

ratio mature/star: 7519.0/13.0 = 578.38
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 482.0/2.0 = 241.0

mature (isoform content): 6.02% (homogeneous)
star (isoform content): 13.33% (heterogeneous)

retinal-ganglion-cell-axon_xla_PRJNA342827

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 14.0/0.0 = None

mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): None

kidney_xla_SRR5753209

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): None

embryo-stage-7-8_xla_SRR2147027

ratio mature/star: 2.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

egg_xla_SRR2147026

ratio mature/star: 777.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 215.0/1.0 = 215.0

mature (isoform content): 21.67% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

embryo-stage-12_xla_SRR2147028

ratio mature/star: 859.0/1.0 = 859.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 55.0/0.0 = None

mature (isoform content): 6.02% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

heart_xla_SRR9989206

ratio mature/star: 0.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 164.0/10.0 = 16.4

mature (isoform content): 100.0% (heterogeneous)
star (isoform content): 100.0% (heterogeneous)

stage-56_xla_SRR2147031

ratio mature/star: 45572.0/95.0 = 479.71

stage-34-36_xla_SRR2147030

ratio mature/star: 7519.0/13.0 = 578.38

embryo-stage-7-8_xla_SRR2147027

ratio mature/star: 2.0/0.0 = None

egg_xla_SRR2147026

ratio mature/star: 777.0/0.0 = None

embryo-stage-12_xla_SRR2147028

ratio mature/star: 859.0/1.0 = 859.0

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	2.68	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	1.79	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	G	C	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.89	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	21.36	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	7	6.35	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	27	34.85	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3	1.43	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	24	21.43	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	A	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.99	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	11	9.82	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	C	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	113	98.4	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	A	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	70	320.23	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	A	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	11	40.98	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	A	A	C	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.89	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.89	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	10.95	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	1.79	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	0.54	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	C	C	A	C	A	G	G	G	U	A	G	A	A	C	C	A	C	G	G	G	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	0.89	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	A	G	U	G	G	U	U	U	U	A	C	C	C	U	A	U	G	G	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	27	24.11	Xla-Mir-140-P2a-v1, Xla-Mir-140-P2a-v2, ...
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