reads

mismatches

statistic

legend

data details

standard experimental all

Reload

- size from to show

Xtr-Mir-430-o5k26

Legend
both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Global results

ratio mature/star: 4087.08/15619.94 = 0.26
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 2670.77/0.0 = None

mature (isoform content): 39.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

animalpole-embryo-stage-10_xtr_SRR505564

ratio mature/star: 101.0/386.0 = 0.26
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 66.0/0.0 = None

mature (isoform content): 39.52% (heterogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	161.86	Xtr-Mir-430-o5k4, Xtr-Mir-430-o5k5, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	87	3520.56	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	10	404.66	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	40.47	Xtr-Mir-430-o5k6, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	74	2994.5	Xtr-Mir-430-o5k6, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	311	12584.98	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	80.93	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	40.47	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	A	G	U	G	C	U	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5	202.33	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
G	A	A	G	U	G	C	U	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	U	G	U	G	U	U	G	U	C	U	U	G	A	U	G	G	U	C	A	G	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	U	C	G	A	U	U	G	G	A	A	A	G	U	U	C	A	A	C	C	C	U	U	G	A	C	A	U	U	U

download reads

Reads

+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	Reads	RPM	Other miRNA genes
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	161.86	Xtr-Mir-430-o5k4, Xtr-Mir-430-o5k5, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	87	3520.56	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	10	404.66	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	40.47	Xtr-Mir-430-o5k6, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	74	2994.5	Xtr-Mir-430-o5k6, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	311	12584.98	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2	80.93	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1	40.47	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	A	G	U	G	C	U	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	5	202.33	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4	161.86	Xtr-Mir-430-o5k5, Xtr-Mir-430-o5k6, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8	323.73	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k2, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	17	687.92	Xtr-Mir-430-o5k1, Xtr-Mir-430-o5k7, ...
-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	C	G	U	A	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	33	1335.38	Xtr-Mir-430-o5l4, Xtr-Mir-430-o5l5, ...
G	A	A	G	U	G	C	U	G	C	A	G	A	C	U	G	A	C	C	A	A	U	U	U	G	A	G	A	U	C	A	C	C	C	A	A	A	A	C	U	G	A	G	C	C	C	U	C	U	C	U	U	G	U	G	U	U	G	U	C	U	U	G	A	U	G	G	U	C	A	G	A	A	A	G	U	G	C	U	U	C	C	U	G	U	U	U	U	G	G	G	U	G	U	A	U	C	G	A	U	U	G	G	A	A	A	G	U	U	C	A	A	C	C	C	U	U	G	A	C	A	U	U	U

download reads

References
Tissue	Paper	Accesion
brain_xtr_SRR1231993	SRR1231993	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24964909
heart_xtr_SRR1231994	SRR1231994	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24964909
embryo-stage-8_xtr_SRR505561	SRR505561	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24065776/
embryo-stage-10_xtr_SRR505562	SRR505562	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24065776/
animalpole-embryo-stage-10_xtr_SRR505564	SRR505564	https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24065776/