MirGeneDB ID | Bge-Mir-153-P17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cockroach (Blattella germanica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bge-Mir-153-P16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-153 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bko-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Cin-Mir-153 Cte-Mir-153 Dgr-Mir-153 Dma-Mir-153 Dpu-Mir-153 Eba-Mir-153 Egr-Mir-153 Gsa-Mir-153 Gsp-Mir-153 Hmi-Mir-153 Hru-Mir-153 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lgi-Mir-153 Llo-Mir-153 Mgi-Mir-153 Mom-Mir-153 Npo-Mir-153 Obi-Mir-153 Ofu-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pau-Mir-153 Pca-Mir-153 Pcr-Mir-153 Pdu-Mir-153 Pfl-Mir-153 Pmi-Mir-153 Pve-Mir-153 Rph-Mir-153 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Snu-Mir-153 Spu-Mir-153 Tur-Mir-153 War-Mir-153 Xbo-Mir-153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | B. germanica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Bger_2.0) |
KZ614489.1: 899330-899388 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCAUCGCUUCCUGCAGAAGGCUCCUCUAAUCAUUUUUGCAAUUACAGCAAUUGUGUAAUUUAACAAUUGCAUAGUAGCAAAAGUGAUUGGAGGGCUGUACUAGCACCUGCCGCUGUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUCAUCGCUUCCUGCAGAA---| U A CA GUGUA GGC CCUCUAAUCAUUUUUGC AUUA GCAAUU A UCG GGAGGUUAGUGAAAACG UGAU CGUUAA U ACUGUCGCCGUCCACGAUCAUG^ - A A- CAAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bge-Mir-153-P17_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAUUUUUGCAAUUACAGCAAUU -23
Get sequence
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Star sequence | Bge-Mir-153-P17_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUGCAUAGUAGCAAAAGUGAUU -59
Get sequence
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