MirGeneDB ID | Cel-Mir-1832-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1832 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGGGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-1832b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cel-Mir-1832-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrIV: 17092861-17092927 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUUUUUCAAUUUUGACUAACUUCGACCAAUCAGCGAAUCGCUCGGCCCACUUUUGUGAACCAAUCAGCGUCAAAAGUGGGCAGAGCGAUUCGCUGAUUGGUCGUUAUCAUUUUGAAAGGAAUUAAGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUUUUCAAUUUUGACUAACUU--| G UGUGAACCA CGACCAAUCAGCGAAUCGCUC GCCCACUUU \ GCUGGUUAGUCGCUUAGCGAG CGGGUGAAA A CGAAUUAAGGAAAGUUUUACUAUU^ A ACUGCGACU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-1832-P2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0011449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAGCGAAUCGCUCGGCCCACUUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0011449 |
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Mature sequence | Cel-Mir-1832-P2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0011450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
44- AGUGGGCAGAGCGAUUCGCUGAU -67
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0011450 TargetScanWorm: cel-miR-1832b |