MirGeneDB ID | Cel-Mir-799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-799 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAACCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrX: 8600657-8600718 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAAAAUAUGUUAGUUUUUCAAUUUUUUUCACCGGUUUUAAAAAGUGGUUUCACAUUCAAUAAAGACAUGUGAACCCUGAUAAAGCUAGUGGAAAUAUCGGAAAACAUUGUUAGGAGCAUAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAAAAUAUGUUAGUUU--| AAUUU CG AAA U U UUCAAU UUC UUUUCAC GUUUUA AG GGUU CACA \ AAG AAAGGUG CGAAAU UC CCAA GUGU A UAUACGAGGAUUGUUACAA^ GCUAU AU AG- - - ACAGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-799_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCGGUUUUAAAAAGUGGUUUCACA -25
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-799_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UGAACCCUGAUAAAGCUAGUGG -62
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004234 TargetScanWorm: cel-miR-799 |