| MirGeneDB ID | Cel-Mir-70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-70 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUACGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cbr-Mir-70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrV: 6665552-6665611 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUUAUUCAAAAUAAAACGAUGAAAACUAUCGAAAUACUAUCGACGAAUAACACUUAUGAAGAAAUGUAAUACGUCGUUGGUGUUUCCAUAGUUUGAAUUGUUUAUUCCAUUAUUUUUGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUUAUUCAAAAUAAAA--| GA C U A A CUUAU CGAU AAACUAU GAAAUACUA CGACG AU ACA G GUUA UUUGAUA CUUUGUGGU GCUGC UA UGU A AGUUUUUAUUACCUUAUUU^ AG C U A A AAAGA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-70_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGAAAUACUAUCGACGAAUAACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-70_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAAUACGUCGUUGGUGUUUCCAU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000042 TargetScanWorm: cel-miR-70 |
