MirGeneDB ID | Dme-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-966 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGGGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dsi-Mir-966 Dya-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2L: 6045642-6045698 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUUUCGCUCGGCUGUAACCUGAUCCGCUGCUGUGGGUUGUGGGCUGUGUGGCUGUGGUAUAGGUGCCGCCAGUUGAUAACCCCCAGCGUGGGCACGGACCCACUGGUCGUCAACCGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AUUUCGCUCGGCUGUAA--- -| A U U G U UGUGG CC UG UCCGC GCUG GGGUUGU GGCUG GUGGC U GG AC GGGUG CGAC CCCAAUA UUGAC CGCCG A CGCCAACUGCUGGUCACCCA C^ - - C G - UGGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-966_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGUGGGUUGUGGGCUGUGUGGCU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005481 TargetScanFly: dme-miR-966 |
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Star sequence | Dme-Mir-966_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0020862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CCGCCAGUUGAUAACCCCCAGC -57
Get sequence
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